mia-2dmany2one-nonrigid - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

mia-2dmany2one-nonrigid - Pagpaparehistro ng isang serye ng mga 2D na larawan

SINOPSIS

mia-2dmany2one-nonrigid -i -o [mga pagpipilian]

DESCRIPTION

mia-2dmany2one-nonrigid Ang program na ito ay nagrerehistro ng lahat ng mga larawan ng isang magkakasunod na bilang na set
ng mga larawan sa isang karaniwang sanggunian na tinukoy ng gumagamit.

Opsyon

File-IO
-i --in-file=(input, kinakailangan); string
set ng data ng perfusion ng input

-o --out-file=(output, kinakailangan); string
Ang pangalan ng file para sa mga rehistradong larawan, pagnunumero at pattern ay ibinabawas sa
data ng pag-input

rehistrasyon
-O --optimizer=gsl:opt=gd,step=0.1
Optimizer na ginagamit para sa minimization

-l --mg-levels=3
mga antas ng multi-resolution na mga antas ng multi-resolution

-f --transForm=spline
uri ng pagbabagong uri ng pagbabago Para sa mga sinusuportahang plugin tingnan
MGA PLUGIN:2dimage/transform

-r --ref=-1
reference frame (-1 == gamitin ang imahe sa gitna)reference frame (-1 == gamitin
larawan sa gitna)

-k --laktawan=0
laktawan ang pagpaparehistro ng mga larawang ito sa simula ng seryeskip
pagpaparehistro ng mga larawang ito sa simula ng serye

Tulong & Impormasyon
-V --verbose=babala
verbosity ng output, pag-print ng mga mensahe ng ibinigay na antas at mas mataas na priyoridad.
Ang mga sinusuportahang priyoridad na nagsisimula sa pinakamababang antas ay:
info - Mga mensahe sa mababang antas
kopyahin o sipiin sa pamamagitan ng pag-aninag - Trace ng tawag sa function
mabigo - Mag-ulat ng mga pagkabigo sa pagsubok
babala - Mga babala
mali - Mag-ulat ng mga error
mag-alis ng mga insekto ‐ Debug na output
mensahe - Mga normal na mensahe
nakamamatay ‐ Iulat lamang ang mga nakamamatay na pagkakamali

--copyright
i-print ang impormasyon sa copyright

-h --tulong
i-print ang tulong na ito

-? --gamit
mag-print ng maikling tulong

--bersyon
i-print ang numero ng bersyon at lumabas

Pagproseso
--mga thread=-1
Maximum na bilang ng mga thread na gagamitin para sa pagproseso, Ang bilang na ito ay dapat na mas mababa
o katumbas ng bilang ng mga lohikal na core ng processor sa makina. (-1:
awtomatikong pagtatantya). Pinakamataas na bilang ng mga thread na gagamitin para sa pagproseso, Ito
Ang numero ay dapat na mas mababa o katumbas ng bilang ng mga lohikal na core ng processor
ang makina. (-1: awtomatikong pagtatantya).

MGA PLUGIN: 1d/splinebc

salamin Mga kundisyon ng hangganan ng spline interpolation na sumasalamin sa hangganan

(walang mga parameter)

ulitin Mga kundisyon ng hangganan ng interpolation ng spline na inuulit ang halaga sa hangganan

(walang mga parameter)

wala Mga kundisyon ng hangganan ng interpolation ng spline na ipinapalagay na zero para sa mga value sa labas

(walang mga parameter)

MGA PLUGIN: 1d/splinekernel

bspline B-spline kernel creation , ang mga sinusuportahang parameter ay:

d = 3; int sa [0, 5]
Spline degree.

omoms Ang paggawa ng kernel ng OMoms-spline, ang mga sinusuportahang parameter ay:

d = 3; int sa [3, 3]
Spline degree.

MGA PLUGIN: 2dimage/gastos

lncc lokal na normalized cross correlation na may masking support., mga sinusuportahang parameter
ay:

w = 5; wala sa [1, 256]
kalahating lapad ng bintana na ginagamit para sa pagsusuri ng naisalokal na krus
ugnayan.

lsd Sukat ng Distansya na Pinakamababang Kuwadrado

(walang mga parameter)

mi Spline parzen based mutual information., Ang mga sinusuportahang parameter ay:

bawasan = 0; lumutang sa [0, 40]
Porsiyento ng mga pixel na i-cut sa mataas at mababang intensity na aalisin
outliers.

mbins = 64; wala sa [1, 256]
Bilang ng histogram bins na ginamit para sa gumagalaw na larawan.

mkernel = [bspline:d=3]; pabrika
Spline kernel para sa paglipat ng imahe parzen hinstogram. Para sa mga sinusuportahang plug-in
tingnan ang PLUGINS:1d/splinekernel

rbins = 64; wala sa [1, 256]
Bilang ng histogram bins na ginamit para sa reference na larawan.

rkernel = [bspline:d=0]; pabrika
Spline kernel para sa reference na imahe parzen hinstogram. Para sa suportadong plug-
ins tingnan ang PLUGINS:1d/splinekernel

ncc normalized na cross correlation.

(walang mga parameter)

ngf Sinusuri ng function na ito ang pagkakatulad ng imahe batay sa normalized na gradient
mga patlang. Ang iba't ibang mga kernel ng pagsusuri ay magagamit., ang mga sinusuportahang parameter ay:

eval = ds; dict
subtype ng plugin. Ang mga sinusuportahang halaga ay:
sq - parisukat ng pagkakaiba
ds ‐ parisukat ng pinaliit na pagkakaiba
tuldok ‐ scalar product kernel
tumawid ‐ cross product kernel

SSD 2D imaga cost: kabuuan ng mga squared differences, ang mga sinusuportahang parameter ay:

autothresh = 0; lumutang sa [0, 1000]
Gumamit ng awtomatikong pag-mask ng gumagalaw na imahe sa pamamagitan lamang ng pagkuha ng mga halaga ng intensity
sa account na mas malaki kaysa sa ibinigay na threshold.

uliran = 0; bool
Itakda kung dapat na gawing normal ang sukatan ng bilang ng mga pixel ng larawan.

ssd-automask
Gastos ng 2D na imahe: kabuuan ng mga squared na pagkakaiba, na may automasking batay sa ibinigay
mga threshold, ang mga sinusuportahang parameter ay:

rthresh = 0; doble
Halaga ng intensity ng threshold para sa reference na larawan.

maggiik = 0; doble
Halaga ng intensity ng threshold para sa pinagmulang larawan.

MGA PLUGIN: 2dimage/fullcost

larawan Pangkalahatang pag-andar ng gastos sa pagkakatulad ng imahe na humahawak din ng multi-resolution
pagpoproseso. Ang aktwal na sukatan ng pagkakatulad ay binibigyan ng karagdagang parameter.,
Ang mga sinusuportahang parameter ay:

gastos = ssd; pabrika
Cost function kernel. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan ang PLUGINS:2dimage/cost

mag-alis ng mga insekto = 0; bool
I-save ang mga intermediate resut para sa pag-debug.

Ref =(input, string)
Larawan ng sanggunian.

SRC =(input, string)
Pag-aaral ng imahe.

timbang = 1; lumutang
bigat ng function ng gastos.

labelimage
Pag-andar ng pagkakatulad sa gastos na nagmamapa ng mga label ng dalawang larawan at humahawak ng label-
pinapanatili ang pagproseso ng multi-resolution., ang mga sinusuportahang parameter ay:

mag-alis ng mga insekto = 0; int sa [0, 1]
isulat ang mga pagbabago sa distansya sa isang 3D na imahe.

maxlabel = 256; int sa [2, 32000]
maximum na bilang ng mga label na dapat isaalang-alang.

Ref =(input, string)
Larawan ng sanggunian.

SRC =(input, string)
Pag-aaral ng imahe.

timbang = 1; lumutang
bigat ng function ng gastos.

maskedimage
Pangkalahatang masked image similarity cost function na humahawak din ng multi-
pagpoproseso ng resolusyon. Ang mga ibinigay na maskara ay dapat na makapal na puno ng mga rehiyon
multi-resolution na pagproseso dahil kung hindi ay maaaring mawala ang impormasyon ng mask
kapag binabawasan ang laki ng imahe. Ang reference mask at ang transformed mask ng
Ang imahe ng pag-aaral ay pinagsama ng binary AT. Ang aktwal na sukat ng pagkakatulad ay ibinigay
ang mga karagdagang parameter., ang mga sinusuportahang parameter ay:

gastos = ssd; pabrika
Cost function kernel. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
PLUGINS:2dimage/maskedcost

Ref =(input, string)
Larawan ng sanggunian.

ref-mask =(input, string)
Reference image mask (binary).

SRC =(input, string)
Pag-aaral ng imahe.

src-mask =(input, string)
Pag-aralan ang mask ng imahe (binary).

timbang = 1; lumutang
bigat ng function ng gastos.

MGA PLUGIN: 2dimage/io

bmp BMP 2D-image input/output support

Mga kinikilalang extension ng file: .BMP, .bmp

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
binary data, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit

datapool Virtual IO papunta at mula sa panloob na data pool

Mga kinikilalang extension ng file: .@

dicom 2D image io para sa DICOM

Mga kinikilalang extension ng file: .DCM, .dcm

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
nilagdaan ang 16 bit, hindi nilagdaan ang 16 bit

exr isang 2dimage io plugin para sa OpenEXR na mga imahe

Mga kinikilalang extension ng file: .EXR, .exr

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
unsigned 32 bit, floating point 32 bit

jpg isang 2dimage io plugin para sa jpeg gray scale na mga imahe

Mga kinikilalang extension ng file: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
unsigned 8 bit

png isang 2dimage io na plugin para sa mga larawang png

Mga kinikilalang extension ng file: .PNG, .png

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
binary data, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit

hilaw Suporta sa output ng RAW 2D-image

Mga kinikilalang extension ng file: .RAW, .raw

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
binary data, 8 bit na nilagdaan, 8 bit na hindi nilagdaan, 16 bit na nilagdaan, 16 bit na hindi nilagdaan,
nilagdaan ang 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
kaunti

tif TIFF 2D-image input/output support

Mga kinikilalang extension ng file: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
binary data, unsigned 8 bit, unsigned 16 bit, unsigned 32 bit

tingnan isang 2dimage io plugin para sa mga larawan ng vista

Mga kinikilalang extension ng file: .V, .VISTA, .v, .vista

Mga sinusuportahang uri ng elemento:
binary data, 8 bit na nilagdaan, 8 bit na hindi nilagdaan, 16 bit na nilagdaan, 16 bit na hindi nilagdaan,
nilagdaan ang 32 bit, unsigned 32 bit, floating point 32 bit, floating point 64
kaunti

MGA PLUGIN: 2dimage/maskedcost

lncc lokal na normalized cross correlation na may masking support., mga sinusuportahang parameter
ay:

w = 5; wala sa [1, 256]
kalahating lapad ng bintana na ginagamit para sa pagsusuri ng naisalokal na krus
ugnayan.

mi Spline parzen based mutual information na may masking., Ang mga sinusuportahang parameter ay:

bawasan = 0; lumutang sa [0, 40]
Porsiyento ng mga pixel na i-cut sa mataas at mababang intensity na aalisin
outliers.

mbins = 64; wala sa [1, 256]
Bilang ng histogram bins na ginamit para sa gumagalaw na larawan.

mkernel = [bspline:d=3]; pabrika
Spline kernel para sa paglipat ng imahe parzen hinstogram. Para sa mga sinusuportahang plug-in
tingnan ang PLUGINS:1d/splinekernel

rbins = 64; wala sa [1, 256]
Bilang ng histogram bins na ginamit para sa reference na larawan.

rkernel = [bspline:d=0]; pabrika
Spline kernel para sa reference na imahe parzen hinstogram. Para sa suportadong plug-
ins tingnan ang PLUGINS:1d/splinekernel

ncc normalized cross correlation na may masking support.

(walang mga parameter)

SSD Kabuuan ng mga parisukat na pagkakaiba sa masking.

(walang mga parameter)

MGA PLUGIN: 2dimage/transform

mag-asawa Affine transformation (anim na antas ng kalayaan), ang mga sinusuportahang parameter ay:

imgboundary = salamin; pabrika
mga kondisyon ng hangganan ng interpolation ng imahe. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
MGA PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; pabrika
kernel ng interpolator ng imahe. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
MGA PLUGIN:1d/splinekernel

matibay Matibay na pagbabagong-anyo (ibig sabihin, pag-ikot at pagsasalin, tatlong antas ng
kalayaan), ang mga sinusuportahang parameter ay:

imgboundary = salamin; pabrika
mga kondisyon ng hangganan ng interpolation ng imahe. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
MGA PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; pabrika
kernel ng interpolator ng imahe. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
MGA PLUGIN:1d/splinekernel

rot-center = [[0,0]]; 2dfvector
Relative rotation center, ibig sabihin <0.5,0.5> ay tumutugma sa gitna ng
suportang parihaba.

pag-ikot Mga pagbabago sa pag-ikot (ibig sabihin, pag-ikot sa isang partikular na sentro, isang antas ng
kalayaan), ang mga sinusuportahang parameter ay:

imgboundary = salamin; pabrika
mga kondisyon ng hangganan ng interpolation ng imahe. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
MGA PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; pabrika
kernel ng interpolator ng imahe. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
MGA PLUGIN:1d/splinekernel

rot-center = [[0,0]]; 2dfvector
Relative rotation center, ibig sabihin <0.5,0.5> ay tumutugma sa gitna ng
suportang parihaba.

pasak Free-form na pagbabagong-anyo na maaaring ilarawan ng isang set ng B-spline coefficients
at isang pinagbabatayan na B-spline kernel., ang mga sinusuportahang parameter ay:

anisorate = [[0,0]]; 2dfvector
anisotropic coefficient rate sa pixels, magiging nonpositive values
na-overwrite ng 'rate' na halaga..

imgboundary = salamin; pabrika
mga kondisyon ng hangganan ng interpolation ng imahe. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
MGA PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; pabrika
kernel ng interpolator ng imahe. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
MGA PLUGIN:1d/splinekernel

pinakabuod = [bspline:d=3]; pabrika
transformation spline kernel.. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
MGA PLUGIN:1d/splinekernel

parusa = ; pabrika
Taon ng parusa sa pagbabago. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
PLUGINS:2dtransform/splinepenalty

singil = 10; lumutang sa [1, inf)
isotropic coefficient rate sa mga pixel.

Isalin Pagsasalin lamang (dalawang antas ng kalayaan), ang mga sinusuportahang parameter ay:

imgboundary = salamin; pabrika
mga kondisyon ng hangganan ng interpolation ng imahe. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
MGA PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; pabrika
kernel ng interpolator ng imahe. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
MGA PLUGIN:1d/splinekernel

vf Ang plug-in na ito ay nagpapatupad ng pagbabagong tumutukoy sa pagsasalin para sa bawat isa
punto ng grid na tumutukoy sa domain ng pagbabagong-anyo., suportado
ang mga parameter ay:

imgboundary = salamin; pabrika
mga kondisyon ng hangganan ng interpolation ng imahe. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
MGA PLUGIN:1d/splinebc

imgkernel = [bspline:d=3]; pabrika
kernel ng interpolator ng imahe. Para sa mga sinusuportahang plug-in tingnan
MGA PLUGIN:1d/splinekernel

MGA PLUGIN: 2dtransform/splinepenalty

divcurl divcurl penalty sa pagbabago, ang mga sinusuportahang parameter ay:

kulutan = 1; lumutang sa [0, inf)
bigat ng parusa sa kulot.

div = 1; lumutang sa [0, inf)
bigat ng parusa sa divergence.

uliran = 0; bool
Itakda sa 1 kung dapat gawing normal ang parusa kaugnay ng larawan
laki.

timbang = 1; lumutang sa (0, inf)
bigat ng lakas ng parusa.

Halimbawa

Irehistro ang serye ng imahe na ibinigay ng mga imaheng 'inputXXXX.png' upang i-reference ang larawan 30. Laktawan ang dalawa
mga imahe sa simula at paggamit ng mutual na impormasyon bilang cost function, at parusahan ang
pagbabago sa pamamagitan ng divcurl na may timbang 5. Itago ang resulta sa 'registeredXXXX.png'.

mia-2dmany2one-nonrigid -i input0000.png -o registered%04d.png -k 2 -r 30 image:cost=mi
divcurl:weight=5

AUTHOR(s)

Gert Wollny

COPYRIGHT

Ang software na ito ay Copyright (c) 1999‐2015 Leipzig, Germany at Madrid, Spain. Dumating ito
na WALANG WARRANTY at maaari mo itong muling ipamahagi sa ilalim ng mga tuntunin ng GNU
PANGKALAHATANG PUBLIC LICENSE Bersyon 3 (o mas bago). Para sa karagdagang impormasyon, patakbuhin ang programa gamit ang
opsyon na '--copyright'.

Gumamit ng mia-2dmany2one-nonrigid online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net