mia-2dsegseriesstats - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

mia-2dsegseriesstats - Suriin ang mga curve ng time-intensity sa mga naka-mask na rehiyon ng serye ng larawan.

SINOPSIS

mia-2dsegseriesstats -o -g [mga pagpipilian]

DESCRIPTION

mia-2dsegseriesstats Ang program na ito ay ginagamit upang suriin ang iba't ibang time-intensity curves sa isang
serye ng mga larawang ibinigay ng isang set ng segmentation. Sa partikular, ang programa ay naaayon sa
suriin ang average na intensity at mga pagkakaiba-iba ng mga seksyon ng kaliwang ventricle myocardium. Ang
Ang segmentation set ay dapat maglaman ng mga segmentation para sa lahat ng slice na maa-access
sa panahon ng pagsusuri.

Opsyon

-o --orihinal=(input, kinakailangan); string
orihinal na set ng segmentation

-g --registered=(input, kinakailangan); string
nakarehistrong set ng segmentation

-k --laktawan=2
mga larawang lalaktawan sa simula ng serye, kung (k < 0) gumamit ng RV peak ng
nakarehistrong set kung ang mga setimage ay lalaktawan sa simula ng serye, kung (k < 0)
gamitin ang RV peak ng nakarehistrong set kung itinakda

-r --reference=-1
reference frame para sa awtomatikong curve extraction. Maaaring gamitin ang mga negatibong halaga
upang ipahiwatig ang mga partikular na halaga (kung ibinigay sa hanay ng segmentation):
-3: Gitna ng serye
-2: ginustong sanggunian
-1: LV peak kung hindi available ang alinman sa itaas o ang value ay < -3,
gamitin ang huling frame ng serye.reference frame para sa awtomatikong curve
pagkuha. Maaaring gamitin ang mga negatibong halaga upang isaad ang mga partikular na halaga (kung
ibinigay sa set ng segmentation):
-3: Gitna ng serye
-2: ginustong sanggunian
-1: LV peak kung hindi available ang alinman sa itaas o ang value ay < -3,
gamitin ang huling frame ng serye.

-c --curves=(output); string
mga curves ng average na halaga ng rehiyon, Ang mga output file bawat isa ay binubuo ng isang talahanayan sa
plain-text na format na naglalaman ng tatlong column para sa bawat seksyon ng LV
myocardium: Ang unang column ay naglalaman ng mga value na nakuha sa pamamagitan ng paggamit ng
orihinal na pagkakahati ng sanggunian sa lahat ng mga larawan ng orihinal na serye,
ang pangalawang hanay ay naglalaman ng mga halaga na nakuha ng nakarehistro
segmentasyon ng sanggunian sa lahat ng mga larawan ng nakarehistrong serye, at
ang ikatlong hanay ay naglalaman ng mga halaga na nakuha sa pamamagitan ng paggamit ng mga segmentasyon ng
bawat hiwa sa orihinal na mga larawan.

-v --varcurves=(output); string
mga halaga ng pagkakaiba-iba ng rehiyon, parehong anyo tulad ng inilarawan sa itaas.

-n --sections=0
bilang ng mga seksyong gagamitin, 0=gamitin bilang naka-segment, kung hindi, ang LV
ang myocardium ay nahahati sa n mga seksyon na nakapaloob sa pantay na mga anggulo simula sa
ang kanang ventricle insertion point na gumagalaw sa orasan gamit ang LV center bilang
angular point.bilang ng mga seksyong gagamitin, 0=gamitin bilang naka-segment, kung hindi
Kung hindi, ang LV myocardium ay nahahati sa n mga seksyon na nakapaloob sa pantay
ang mga anggulo na nagsisimula sa kanang ventricle insertion point na gumagalaw sa orasan
gamit ang LV center bilang angular point.

Tulong & Impormasyon
-V --verbose=babala
verbosity ng output, pag-print ng mga mensahe ng ibinigay na antas at mas mataas na priyoridad.
Ang mga sinusuportahang priyoridad na nagsisimula sa pinakamababang antas ay:
info - Mga mensahe sa mababang antas
kopyahin o sipiin sa pamamagitan ng pag-aninag - Trace ng tawag sa function
mabigo - Mag-ulat ng mga pagkabigo sa pagsubok
babala - Mga babala
mali - Mag-ulat ng mga error
mag-alis ng mga insekto ‐ Debug na output
mensahe - Mga normal na mensahe
nakamamatay ‐ Iulat lamang ang mga nakamamatay na pagkakamali

--copyright
i-print ang impormasyon sa copyright

-h --tulong
i-print ang tulong na ito

-? --gamit
mag-print ng maikling tulong

--bersyon
i-print ang numero ng bersyon at lumabas

Pagproseso
--mga thread=-1
Maximum na bilang ng mga thread na gagamitin para sa pagproseso, Ang bilang na ito ay dapat na mas mababa
o katumbas ng bilang ng mga lohikal na core ng processor sa makina. (-1:
awtomatikong pagtatantya). Pinakamataas na bilang ng mga thread na gagamitin para sa pagproseso, Ito
Ang numero ay dapat na mas mababa o katumbas ng bilang ng mga lohikal na core ng processor
ang makina. (-1: awtomatikong pagtatantya).

Halimbawa

Suriin ang dalawang curve na na-type para sa 12 seksyon mula sa segemntation sets orig.set at reg.set
laktawan ang unang 2 frame. Ang output ay isusulat sa curves.txt at varcurves.txt
ayon sa pagkakabanggit.

mia-2dsegseriesstats -i org.set -g reg.set -c curves.txt -v varcurves.txt -n 12 -k 2

AUTHOR(s)

Gert Wollny

COPYRIGHT

Ang software na ito ay Copyright (c) 1999‐2015 Leipzig, Germany at Madrid, Spain. Dumating ito
na WALANG WARRANTY at maaari mo itong muling ipamahagi sa ilalim ng mga tuntunin ng GNU
PANGKALAHATANG PUBLIC LICENSE Bersyon 3 (o mas bago). Para sa karagdagang impormasyon, patakbuhin ang programa gamit ang
opsyon na '--copyright'.

Gumamit ng mia-2dsegseriesstats online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net