Ito ang command na miraSearchESTSNPs na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
miraSearchESTSNPs - Pipeline para tumuklas ng mga SNP sa EST mula sa iba't ibang strain
DESCRIPTION
Ang program na miraSearchESTSNPs ay maaaring gamitin para sa pag-assemble ng EST data mula sa iba't ibang strain
(o mga organismo) at SNP detection sa loob ng pagpupulong na ito. Ito ang dating miraEST program
na pinalitan ng pangalan dahil maraming tao ang nalilito kung gagamitin ang MIRA sa est mode o
miraEST.
Ang miraSearchESTSNPs ay isang pipeline na nagre-reconstruct ng malinis na mRNA transcript sequence
natipon sa EST sequencing projects ng higit sa isang strain, na maaaring maging maaasahang batayan
para sa kasunod na mga hakbang sa pagsusuri tulad ng clustering o exon analysis. Nangangahulugan ito na kahit na ang mga gene
na naglalaman lamang ng isang na-transcribe na SNP sa iba't ibang mga alleles ay unang itinuturing na naiiba
mga transcript. Ang opsyonal na huling hakbang ng proseso ng pagpupulong ay maaaring i-configure bilang simple
clusterer na maaaring mag-assemble ng mga transcript na naglalaman ng parehong exon sequence -- ngunit lamang
naiiba sa mga posisyon ng SNP -- sa isang pagkakasunud-sunod ng pinagkasunduan. Ang ganitong mga SNP ay maaaring masuri,
inuri at mapagkakatiwalaang itinalaga sa kanilang kaukulang mRNA transcriptome sequence.
Gayunpaman, mahalagang tandaan na ang miraSearchESTSNPs ay isang assembler at hindi isang buo
hinipan na tool sa clustering.
SINOPSIS
Sa bersyon 3.9.17 ang functionality na ito ay na-deactivate.
Gamitin ang miraSearchESTSNPs online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
