Ito ang command na TransDecoder.LongOrfs na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
Transdecoder.LongOrfs - Transcriptome Protein Prediction
PAGGAMIT
Kailangan:
-t transcripts.fasta
Opsyonal:
-m pinakamababang haba ng protina (default: 100)
-G genetic code (default: universal; tingnan ang PerlDoc; mga opsyon: Euplotes, Tetrahymena, Candida, Acetabularia)
-S strand-specific (nagsusuri lamang sa tuktok na strand)
Genetic Mga Code
Tingnan mohttp://golgi.harvard.edu/biolinks/gencode.html>. Ang mga ito ay kasalukuyang sinusuportahan:
pangkalahatan (default)
Euplotes
Tetrahymena
Candida
Acetbularia
Mitochondrial-Canonical
Mitochondrial-Vertebrates
Mitochondrial-Artropods
Mitochondrial-Echinoderms
Mitochondrial-Molluscs
Mitochondrial-Ascidians
Mitochondrial-Nematodes
Mitochondrial-Platyhelminths
Mitochondrial-Yeasts
Mitochondrial-Euascomycetes
Mitochondrial-Protozoans
2015-12-28 TRANSDECODER.LONGORFS(1)
Gamitin ang TransDecoder.LongOrfs online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
