Ito ang Linux app na pinangalanang GenOO-HTS na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang genoo-code-2013_04_18.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang GenOO-HTS para tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
Ang GenOO-HTS ay tatakbo sa Linux online
DESCRIPTION
Ang GenOO-HTS [jee-noo] ay isang open-source; object-oriented Perl framework na partikular na binuo para sa disenyo ng mga tool sa pagsusuri ng High Throughput Sequencing (HTS). Ang pangunahing layunin ng GenOO-HTS ay gawing madali ang mga simpleng pagsusuri sa HTS at posible ang mga kumplikadong pagsusuri. Ang GenOO-HTS ay nagmomodelo ng mga biological entity sa Perl object at nagbibigay ng mga nauugnay na katangian at pamamaraan na nagbibigay-daan para sa pagmamanipula ng mataas na throughput sequencing data. Ang paggamit ng GenOO-HTS bilang isang pangunahing module ng pag-unlad ay binabawasan ang overhead at pagiging kumplikado ng pamamahala sa data at mga biological entity na nasa kamay. Ang GenOO-HTS ay idinisenyo upang maging flexible, madaling mapalawak na may modular na istraktura at minimal na mga kinakailangan para sa mga panlabas na tool at library.Mga tampok
- Ayusin ang mga biological entity bilang mga perl object (genomic na rehiyon, gene, transcript, intron/exon, atbp)
- Ayusin ang mga sequencing entity bilang perl object/attribute (sequencing reads, alignments, etc)
- Gawing madali ang I/O mula sa malawakang ginagamit na mga format ng file (SAM, BED, FASTA, FASTQ)
- Maging pare-pareho at madaling mapalawak
Audience
Agham/Pananaliksik, Mga Nag-develop
Wika ng Programming
Perl
Ito ay isang application na maaari ding makuha mula sa https://sourceforge.net/projects/genoo/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
