Ito ang Linux app na pinangalanang GMATA software para sa Genomic SSR marker na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang GMATAv2.2.jar. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang GMATA software para sa Genomic SSR marker na may OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
GMATA software para sa Genomic SSR marker
DESCRIPTION
Ano ang software na GMATA v21
Ang Genome-wide Microsatellite Analyzing Toward Application (GMATA) ay isang software para sa mga pagsusuri sa Simple Sequence Repeats (SSR), at pagdidisenyo at pagmamapa ng SSR marker sa anumang mga sequence ng DNA. Ito ay may mga sumusunod na function:
1. Pagmimina ng SSR;
2. Pagsusuri at paglalagay ng estadistika;
3. SSR loci graphic na pagtingin;
4. Pagdidisenyo ng marker;
5. Electronic mapping at pagsisiyasat sa kakayahang ilipat ng marker.
Ang GMATA ay tumpak, sensitibo at mabilis. Idinisenyo ito upang iproseso ang malalaking genomic sequence data set, lalo na ang malalaking buong genome sequence. Sa teorya, ang mga genome ng anumang laki ay madaling masuri ng GMATA. Gumagana ang software GMATA sa sever, desktop o kahit na laptop, at maaari itong tumakbo sa graphic na interface sa mga pag-click lang o tumakbo sa command line o sa automated pipeline. Ito rin ay cross-platform at sumusuporta sa Unix/Linux, Win at Mac. Ang mga resulta mula sa software na GMATA ay maaaring direktang graphical na ipakita na may genome o gene features sa Gbrowser at madaling isama sa anumang genomic database.
Mga tampok
- Tumpak at pinakamabilis na pagmimina ng SSR sa anumang malalaking sequence
- Kumpletuhin ang statistical analysis at plotting
- SSR loci at marker graphic na ipinapakita sa Gbrowser na may mga tampok na genome
- Partikular na pagdidisenyo ng marker ng SSR, at kunwa ng PCR
- Electronic mapping, at pagsisiyasat sa kakayahang ilipat ng marker
- magagamit din sa https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/gmata/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
