Ito ang Linux app na pinangalanang miRDP2 na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang miRDP2-v1.1.4.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang miRDP2 para tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
miRDP2 upang tumakbo sa Linux online
Ad
DESCRIPTION
Ang miRDeep-P2 (miRDP2) ay binuo upang tumpak at mabilis na pag-aralan ang microRNAs (miRNAs) transcriptome sa mga halaman. Ito ay pinagtibay mula sa miRDeep-P (miRDP) na may mga bagong diskarte at inayos na algorithm. Sinubukan namin ang miRDP2 upang pag-aralan ang mga transcriptome ng miRNA sa naturang mga halaman na may unti-unting pagtaas ng laki ng genome bilang Arabidopsis, bigas, kamatis, mais at trigo. Kung ikukumpara sa miRDeep-P at ilang iba pang computational tool, pinoproseso ng miRDP2 ang data ng NGS na may superyor na bilis. Sa pamamagitan ng pagsasama ng bagong na-update na pamantayan ng annotation ng miRNA ng halaman, ang katumpakan ng miRDP2 ay kapansin-pansing napabuti din. Ang aming mga resulta ay nagpapakita ng miRDP2 bilang isang mabilis at tumpak na tool para sa pagsusuri ng miRNA transcriptome sa mga halaman.Sanggunian: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty972
Mga tampok
- maliit na RNA
- microRNA(miRNA)
- Susunod na Generation Sequencing (NGS)
- Perl
Audience
Agham/Pananaliksik
Wika ng Programming
Perl
Kapaligiran ng Database
Perl DBI/DBD
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/mirdp2/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
