Ito ang Linux app na pinangalanang Pipeline Builder para sa mga tool ng NGS na tumakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang pipeline_builder_20150106-1044-build-baf32e1.tar.gz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang Pipeline Builder para sa mga tool ng NGS upang tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
Pipeline Builder para sa mga tool ng NGS na tatakbo sa Linux online
DESCRIPTION
Ang paghawak sa mga file ng configuration ng NGS tool ay isang tunay na hamon para sa mga modernong biologist at biotechnologist. Upang mapataas ang pagiging produktibo, pagiging tiyak at mapahusay ang pagpoproseso ng data, ang tool na ito ay nagbibigay ng isang koleksyon ng mga command na nakabalangkas na, na humahantong sa user sa pagbuo ng tamang pipeline para sa data na kailangan niyang suriin.Ang Pipeline Builder ay isang scripting tool para sa pamamahala ng mga kumplikadong NGS analysis pipelines. Tinutulungan nito ang gumagamit sa pagbubuo ng mga utos ng tool ng NGS at pagbubuo ng sarili niyang pipeline ng pagsusuri. Nagbibigay-daan ito para sa data independent reproducible analysis na lumilikha ng protektadong kapaligiran na naghihiwalay sa data mula sa mga resulta sa pamamagitan ng variable na pag-export. Dumating ito bilang command-line tool na may mga wizard menu at step-by-step na tutorial.
Ang Pipeline Builder ay nakasulat sa Perl at ito ay crossplatform.
Mga tampok
- gusali ng pipeline ng NGS
- NGS tool parallel calling
- Pag-iimbak ng data nang walang overlapping at redundancy
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
Perl
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/pipelinebuilder/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.
