Ito ang Linux app na pinangalanang RNASeq-MATS na tatakbo sa Linux online na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang testData.tgz. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang RNASeq-MATS para tumakbo sa Linux online gamit ang OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Simulan ang OnWorks Linux online o Windows online emulator o MACOS online emulator mula sa website na ito.
- 5. Mula sa OnWorks Linux OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application, i-install ito at patakbuhin ito.
MGA LALAKI
Ad
Ang RNASeq-MATS ay tatakbo sa Linux online
DESCRIPTION
Ang MATS ay isang computational tool upang matukoy ang differential alternative splicing event mula sa RNA-Seq data. Kinakalkula ng istatistikal na modelo ng MATS ang P-value at false discovery na rate na ang pagkakaiba sa isoform ratio ng isang gene sa pagitan ng dalawang kundisyon ay lumampas sa ibinigay na threshold na tinukoy ng user. Mula sa data ng RNA-Seq, maaaring awtomatikong matukoy at masuri ng MATS ang mga alternatibong kaganapan sa pag-splice na naaayon sa lahat ng pangunahing uri ng mga alternatibong pattern ng splicing. Pinangangasiwaan ng MATS ang replicate na data ng RNA-Seq mula sa parehong nakapares at hindi nakapares na disenyo ng pag-aaral. Higit pang impormasyon ay matatagpuan sa http://rnaseq-mats.sourceforge.net.Ito ay isang application na maaari ding makuha mula sa https://sourceforge.net/projects/rnaseq-mats/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.