Ito ang Windows app na pinangalanang VarScan na ang pinakabagong release ay maaaring ma-download bilang VarScan.v2.3.9.jar. Maaari itong patakbuhin online sa libreng hosting provider na OnWorks para sa mga workstation.
I-download at patakbuhin online ang app na ito na pinangalanang VarScan sa OnWorks nang libre.
Sundin ang mga tagubiling ito upang patakbuhin ang app na ito:
- 1. Na-download ang application na ito sa iyong PC.
- 2. Ipasok sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX kasama ang username na gusto mo.
- 3. I-upload ang application na ito sa naturang filemanager.
- 4. Magsimula ng anumang OS OnWorks online emulator mula sa website na ito, ngunit mas mahusay na Windows online emulator.
- 5. Mula sa OnWorks Windows OS na kasisimula mo pa lang, pumunta sa aming file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXX gamit ang username na gusto mo.
- 6. I-download ang application at i-install ito.
- 7. I-download ang Wine mula sa iyong mga Linux distributions software repository. Kapag na-install na, maaari mong i-double click ang app upang patakbuhin ang mga ito gamit ang Wine. Maaari mo ring subukan ang PlayOnLinux, isang magarbong interface sa ibabaw ng Wine na tutulong sa iyong mag-install ng mga sikat na programa at laro sa Windows.
Ang alak ay isang paraan upang patakbuhin ang software ng Windows sa Linux, ngunit walang kinakailangang Windows. Ang alak ay isang open-source na layer ng compatibility ng Windows na maaaring direktang magpatakbo ng mga program sa Windows sa anumang desktop ng Linux. Sa totoo lang, sinusubukan ng Wine na muling ipatupad ang sapat na Windows mula sa simula upang mapatakbo nito ang lahat ng mga Windows application na iyon nang hindi talaga nangangailangan ng Windows.
MGA LALAKI
Ad
VarScan
DESCRIPTION
Variant detection sa massively parallel sequencing. Para sa isang sample, tumatawag sa mga SNP, indels, at consensus genotypes. Para sa mga tumor-normal na pares, higit pang inuuri ang bawat variant bilang Germline, Somatic, o LOH, at nakikita rin ang mga pagbabago sa numero ng kopya ng somatic. ANG PINAKABAGONG VERSION AY AVAILABLE SA GITHUB
Mga tampok
- Tumatawag sa mga SNP at Indel mula sa SAMtools pileup file
- Sinasala ang mga variant ayon sa saklaw, lalim ng pagbasa, dalas ng variant, at kalidad ng base
- Tinutukoy ang somatic status (Somatic, Germline, LOH) para sa Tumor-Normal na pares
- Pinaghahambing, pinagsasama, at pinag-intersect ang dalawang listahan ng mga variant
- Nililimitahan ang mga variant na tawag sa isang hanay ng mga target na posisyon o target na rehiyon
- Libre para sa hindi pangkomersyal na paggamit.
Audience
Agham/Pananaliksik
Interface ng gumagamit
Command-line
Wika ng Programming
Java
Kategorya
Ito ay isang application na maaari ding kunin mula sa https://sourceforge.net/projects/varscan/. Na-host ito sa OnWorks upang mapatakbo online sa pinakamadaling paraan mula sa isa sa aming mga libreng Operative System.