Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen asn2ff komutudur.
Program:
ADI
asn2ff - ASN.1 biyolojik verilerini düz bir biçime dönüştürün (eski sürüm)
SİNOPSİS
asn2ff [-] [-A X] [-B X] [-C] [-G] [-L F] [-M] [-R] [-V F] [-a Dosya] [-b] [-d] [-e]
[-f s/p/e/s/x/z] [-g] [-h F] [-k F] [-l Dosya] [-m r/d/s/c/k/l/e/p] [-n F]
[-o Dosya] [-p F] [-q] [-r Dosya] [-s] [-t] [-v F] [-w] [-y] [-z]
TANIM
asn2ff biyolojik dizilerin açıklamalarını NCBI'nin ASN.1 formatından birine dönüştürür
birkaç düz dosya formatı. Bu program, kullanımdan kaldırılmış bir arabirim etrafında oluşturulmuştur; lütfen
kullanım asn2gb(1) yerine.
SEÇENEKLER
Seçeneklerin bir özeti aşağıda yer almaktadır.
- Kullanım mesajını yazdır
-A X Şu andan itibaren bölgeyi göster: X (varsayılan 0'dir)
-B X ile biten bölgeyi göster X (varsayılan son konumdur)
-C Bankit yorumlarını göster
-G Çıktı, yalnızca genom görünümünde bir üst bioseq'dir
-L F Eski (Genbank 127.0 öncesi) LOCUS satır biçimini kullan
-M Çıktı yalnızca harita bioseqs'dir
-R GenBank Sürümü İçin
-V F VERSİYONU kullanmayın
-a Dosya
ASN.1 girişi için dosya adı (varsayılan stdin'dir)
-b İkili modda asnfile girin
-d SeqMgr indekslemeyi kullan
-e Giriş bir Sıralı giriştir
-f s/p/e/s/x/z
Çıkış biçimi:
b GenBank (varsayılan)
p GenPept
EMBL
s SözdeEMBL
x GenBankSeçimi
z EMBLPEPT
-g gi numaralarını göster
-h F Sıralamayı gizle
-k F Karmaşık kümeler kullanmayın (phy-set,mut-set, pop-set)
-l Dosya
Hataları günlüğe kaydet Dosya
-m r/d/s/c/k/l/e/p
Çıkış modu:
r serbest bırakma (varsayılan)
d dökümü
payet
c Kromoskop
k dizin-alt hata ayıklama
l dir-alt
e gözden geçir
p kısmi rapor
-n F Sıkı gen bağlama
-o Dosya
Çıktı Dosya Adı (varsayılan stdout'tur)
-p F Yeni gen özelliklerini atlayın
-q Çıktı yalnızca bir üst bioseq'dir
-r Dosya
Çıktı hatası günlük dosyası (varsayılan stderr'dir)
-s Girdi bir Seq-göndermedir
-t Ayrıntılı mesaj metnini göster
-v F Hata mesajlarını bastır
-w HTML çıktı biçimini kullan
-y Yalnızca yardım biçimini yazdır
-z Organnameler için yeni algoritma
onworks.net hizmetlerini kullanarak asn2ff'i çevrimiçi kullanın
