Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen komut demux'udur.
Program:
ADI
demux - XPLOR mesafe sınırlamalarını Gromacs formatına dönüştürün
SİNOPSİS
Demux md0.log ekstra
TANIM
Yörüngelerinizi tekrar sürekli hale getirmek istiyorsanız, kullanabilirsiniz. Demux okumak
md0.log dosyanız (gerekirse birkaçını birleştirebilirsiniz) ve birkaç çıktı üretin
Dosyalar. Bunlardan biri bir .xvg dosyasıdır (replika_ndx.xvg) geçirilebilir trjcat(1) boyunca
sürekli yörüngeler üretmek için orijinal yörünge dosyaları ile. diğer
dosya (replika_temp.xvg) her kopya için sıcaklıkları içerir,
orijinal sıcaklık. Yani, ilgi alanınız örneğin 300 K'da başlıyorsa, takip edebilirsiniz.
sıcaklık uzayı boyunca yörüngesi. biraz eklemek ilginç olurdu
her bir kopya için sıcaklık dağılımlarının histogramlarını yapma işlevi,
çoğu yazara göre düz olmalıdır. Demuxed yörüngeler ile kullanılabilir
g_kinetik(1) REMD yörüngelerinden protein katlama kinetiği elde etmek için.
SEÇENEKLER
md0.log Sürekli yapmak istediğiniz yörünge çalışmasının günlük dosyası. Birden fazla dosya olabilir
birlikte eklenir.
ekstra Günlük dosyasındaki her girişin kopyalanma sayısı. (Tamsayı)
KISITLAMALAR
Değişiminiz her N ps ise ve her M ps'yi kaydettiyseniz, eksikler için yapabilirsiniz.
ayarlayarak çerçeveler ekstra (N/M - 1). N/M tamsayı değilse, şansınız kalmaz ve
yörüngelerinizi hiçbir şekilde ayrıştıramayacak.
onworks.net hizmetlerini kullanarak çevrimiçi demux kullanın
