Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen fuzznuce komutudur.
Program:
ADI
fuzznuc - Nükleotid dizilerindeki kalıpları ara
SİNOPSİS
tüysüz -sıra devamı -Desen model -Tamamlayıcı boole -outfile rapor
tüysüz -Yardım
TANIM
tüysüz EMBOSS'un (“Avrupa Moleküler Biyoloji Açık
Yazılım Paketi”). "Nucleic:Motifs" komut grup(lar)ının bir parçasıdır.
SEÇENEKLER
Giriş Bölüm
-sıra devamı
-Desen model
Nükleotidler için standart IUPAC tek harfli kodları kullanılır. 'n' sembolü
herhangi bir nükleotidin kabul edildiği bir pozisyon için kullanılır. Belirsizlikler ile gösterilir
belirli bir pozisyon için kabul edilebilir nükleotidlerin kare parantezler arasında listelenmesi '[
]'. Örneğin: [ACG], A veya C veya G anlamına gelir. Belirsizlikler ayrıca şu şekilde gösterilir:
kabul edilmeyen nükleotidleri bir çift süslü parantez '{ }' arasında listeleme
belirli bir pozisyonda. Örneğin: {AG}, A ve G dışında herhangi bir nükleotid anlamına gelir. Her biri
bir desendeki eleman komşusundan bir '-' ile ayrılır. (fuzznuc'ta isteğe bağlı).
Desenin bir elemanının tekrarı, o eleman takip edilerek belirtilebilir.
sayısal bir değer veya parantez arasında sayısal bir aralık ile. Örnekler: N(3)
NNN'ye karşılık gelir, N(2,4) NN veya NNN veya NNNN'ye karşılık gelir. Bir desen olduğunda
bir dizinin ya 5' ya da 3' ucuyla sınırlıdır, bu model ya bir
'<' sembolü veya sırasıyla bir '>' sembolü ile biter. Bir nokta deseni bitirir.
(fuzznuc'ta isteğe bağlı). Örneğin, [CG](5)TG{A}N(1,5)C
gelişmiş Bölüm
-Tamamlayıcı boole
Varsayılan değer: N
Çıktı Bölüm
-outfile rapor
onworks.net hizmetlerini kullanarak fuzznuce çevrimiçi kullanın
