Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen gdcm2vtk komutudur.
Program:
ADI
gdcm2vtk - VTK tarafından desteklenen bir dosyayı DICOM'a dönüştürün.
SİNOPSİS
gdcm2vtk [seçenekler] dosya girişi dosya çıkışı
TANIM
The gdcm2vtk VTK tarafından desteklenen herhangi bir dosyayı (DICOM dosyası dahil) girdi olarak alır ve
çıktı olarak bir DICOM dosyası oluşturun.
PARAMETRELERİ
dosya girişi dosya adı (DICOM veya VTK desteklenir)
dosya çıkışı çıktı dosya adı (DICOM veya VTK destekli)
SEÇENEKLER
özel seçenekleri
--force-rescale force-rescale.
--force-space kuvvet aralığı.
--palette-color desteklendiğinde bir PALETTE COLOR dosyası oluşturur.
--argb desteklendiğinde bir ARGB dosyası oluşturur.
--compress desteklendiğinde sıkıştırılmış bir dosya oluşturur.
--use-vtkdicom vtkDICOMImageReader'ı kullanın (GDCM yerine).
--modalite seti Modalite.
--alt-sol ayar sol altta.
--shift vardiyayı ayarlar.
-- ölçek kümesi ölçeği.
--compress set sıkıştırması (MetaIO).
-T --study-uid Çalışma UID'si.
-S --series-uid Serisi UID.
--root-uid Kök UID.
sıkıştırma seçenekleri
-J --jpeg Görüntüyü jpeg olarak sıkıştır.
-K --j2k Görüntüyü j2k olarak sıkıştır.
-L --jpegls Görüntüyü jpeg-ls olarak sıkıştır.
-R --rle Görüntüyü rle olarak sıkıştır (yalnızca kayıpsız).
genel seçenekleri
-h -- yardım
bu yardım metnini yazdırın ve çıkın
-v --versiyon
sürüm bilgilerini yazdır ve çık
-V --ayrıntılı
ayrıntılı mod (uyarı+hata).
-W --uyarı
uyarı modu, uyarı bilgilerini yazdır
-E --hata
hata modu, hata bilgilerini yazdır
-D --hata ayıklama
hata ayıklama modu, hata ayıklama bilgilerini yazdır
çevre değişken
GDCM_ROOT_UID Kök UID
TANIM
VTK tarafından desteklenen bir dosyayı DICOM'a dönüştürün.
Tipik kullanım:
$ gdcm2vtk girdi dosyası çıktısı.dcm
Bir dosyayı tanımak için VTK'nın dahili fabrika mekanizmasını kullanır (CanRead işlevi). Görmek
VTK destekli dosya burada:
VTK hangi görüntü dosyası formatlarını okuyabilir ve yazabilir? http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ#What_image_file_formats_can_VTK_read_and_write.3F
Girdi dosyanızın 4 bileşeni varsa, 4. kompozisyon (alfa) çıktıdan kaldırılacaktır.
DICOM artık alfa bileşenini desteklemediği için dosya (bkz. –argb seçeneği).
Aşağıdaki dosya formatı için özel dikkat gösterildi:
1. DICOM: Yön Kosinüsleri ve vtkMedicalImageInformation çıktıya aktarılır
2. BMP: Dosya bir Arama Tablosu ile kaydedilebilir (bkz. --palette-color)
3. GE Signa: vtkMedicalImageProperties çıktıya geçirilir
4. MINC: Çıkışa Yön Kosinüsleri iletilir
5. TIFF: vtkTIFFReader şu anda VTK'da kötü durumda (VTK 5.2 ve git/master'da farklı davranış). Sadece ne yaptığınızı biliyorsanız kullanın.
CONVERT MetaResim (mhd, mha)
$ gdcm2vtk girdi dosyası çıktısı.mha
Bu komut, girdi DICOM dosyasını: girdi dosyasını bir MetaImage .mha dosyasına dönüştürür. Aynı
.mhd dosyası için gider.
CONVERT MHA/MHD
$ gdcm2vtk girdi dosyası çıktısı.mha
or
$ gdcm2vtk girdi dosyası çıktısı.mhd
Bu komut, girdi DICOM dosyasını: girdi dosyasını bir MetaImageData .mha/.mhd'ye dönüştürür.
dosyası.
CONVERT VTI
$ gdcm2vtk girdi dosyası çıktı.vti
Bu komut, giriş DICOM dosyasını dönüştürecektir: inputfile, bir XML VTK ImageData .vti'ye
dosyası.
CONVERT VTK
$ gdcm2vtk girdi dosyası çıktı.vtk
Bu komut, giriş DICOM dosyasını dönüştürecektir: inputfile, eski bir VTK Structured dosyasına
PointSets .vtk dosyası.
CONVERT DICOM
$ gdcm2vtk girdi.dcm çıktı.dcm
vtkGDCMImageReader varsayılan değil, bir DICOM dosyasında okumak için kullanılacaktır
vtkDICOMImageReader. vtkDICOMImageReader'ı kullanmak için –use-vtkdicom seçeneğine bakın.
GİDİŞ DICOM TO MHD TO DICOM
$ gdcm2vtk girdi_ybr.dcm çıktı.mhd
$ gdcm2vtk --modalite US --imageformat 7 output.mhd output.dcm
Yukarıdaki referans, Fotometrik Yorumlama kullanılarak bir DICOM'un nasıl dönüştürüleceğini gösterir.
YBR_FULL (veya hatta YBR_FULL_422 kayıplı) başka bir dosya biçimine dönüştürün: MetaImage (mhd). Dan beri
bu dosya formatı renk uzayını işlemez, onu kullanarak açıkça ayarlamamız gerekir.
–imageformat komut satırı seçeneği. -modalite komut satırı seçeneği bu bölümde gereklidir.
varsayılan İkincil Yakalama Görüntü Depolama Sınıfı ailesi YBR'ye izin vermediğinden
Fotometrik Yorum.
GDCM2VTK NOTLAR
ÖNEMLİ NOT: Yapılandırılmış dahili VTK, DICOM girişinden doldurulacak ve ardından
çıkış DICOM yazıcısına geçin. Dönüştürme sırasında bazı bilgiler kaybolabilir
DICOM'dan VTK'ya DICOM'a. Bu seçenek çoğunlukla test etmek için kullanılır.
vtkGDCMImageReader/vtkGDCMImageWriter kombinasyonu.
ÖNEMLİ NOT: JPEG gibi kayıplı bir formattan dönüştürme yaparken,
kayıpsızlık önemlidir. DICOM çıktısı, gerekli Kayıplı Görüntüyü içerecektir
Görüntünün bir yerde kayıplı sıkıştırılmış olduğunu belirten sıkıştırma özelliği
boru hattı. Ayrıca bkz. gdcmimg (genel olarak JPEG'in daha iyi işlenmesi).
ÖNEMLİ NOT: –use-vtkdicom kullanılırken, çıktı DICOM dosyası her zaman şu şekilde yazılır:
Bu bilgi okuyucunun kendisinde mevcut olmadığından MR Görüntü Depolama. Bu izin
Görüntü Yönünü (Hasta) doğru şekilde ayarlayın.
onworks.net hizmetlerini kullanarak gdcm2vtk'yi çevrimiçi kullanın
