Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen glam2-purge komutudur.
Program:
ADI
glam2-purge - FASTA dosyasındaki gereksiz dizileri kaldırır
SİNOPSİS
glam2-purge dosya Gol [seçenekleri]
TANIM
glam2-purge Andrew Neuwald'ın kitabının değiştirilmiş bir versiyonudur. tasfiye gereksizleri ortadan kaldıran program
FASTA dosyasındaki diziler. Çok benzer durumları önlemek için bu önerilir.
Motif arayışını bozan diziler. Arındırma DNA veya proteinle çalışır
dizileri oluşturur ve hiçbir iki dizinin (boşluksuz) yerel olmayacağı şekilde bir çıktı dosyası oluşturur
hizalama puanının kullanıcı tarafından belirlenen eşikten büyük olması. Çıktı dosyası adlandırılır
. . Hizalama puanı, proteinler için BLOSUM62 matrisine ve
DNA için +5/-1 puanlama şeması. Temizleme aynı zamanda tandem tekrarları maskelemek için de kullanılabilir. Şunu kullanır:
Bu amaç için XNU programı.
SEÇENEKLER
-n
Diziler DNA'dır (varsayılan: protein).
-b
Hızlı buluşsal yöntemi kullanın (protein için varsayılan).
-e
Kapsamlı bir yöntem kullanın (DNA için varsayılan).
-q
Setteki ilk sırayı koruyun.
-x
Protein tandem tekrarlarını maskelemek için xnu'yu kullanın.
onworks.net hizmetlerini kullanarak glam2-purge'ı çevrimiçi kullanın
