Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen hmm2fetch komutudur.
Program:
ADI
hmm2fetch - HMM veritabanından bir HMM al
SİNOPSİS
hmm2fetch [seçenekler] veritabanı isim
TANIM
hmm2fetch adlı bir HMM'yi alan küçük bir yardımcı programdır. isim bir HMMER modeli veritabanından
denilen veri tabanı. yeni bir biçimde ve bu modeli standart çıktıya yazdırır. Örneğin,
hmm2fetch Pfam RRM varsa, RRM (RNA tanıma motifi) modelini Pfam'dan alır.
ortam değişkeni HMMERDB, Pfam veritabanının konumuna ayarlanır. alınan
HMM dosyası HMMER 2 ASCII formatında yazılmıştır.
Veritabanı, ilişkili bir GSI dizin dosyasına sahip olmalıdır. Bir HMM veritabanını indekslemek için
program hmm2index.hmmXNUMXindex.
SEÇENEKLER
-h Kısa yardım yazdırın; dahil olmak üzere tüm seçeneklerin sürüm numarasını ve özetini içerir.
uzman seçenekleri.
-n Yorumlamak isim ad yerine HMM numarası olarak. Numaralandırma 0'dan başlar.
örneğin, adlı bir HMM veritabanından ilk HMM'yi getirmek için aptal, yapardın
hmm2fetch -n 0 foo.
onworks.net hizmetlerini kullanarak hmm2fetch'i çevrimiçi kullanın
