Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen komut placnet'idir.
Program:
ADI
placnet - Plasmid Constellation Network projesi
AÇIKLAMA
Placnet, NGS projelerinde plazmit analizi için yeni bir araçtır. Placnet çalışmak için optimize edildi
Illumina dizileri ile birlikte çalışır, ancak aynı zamanda 454, Iontorrent veya herhangi bir gerçek
sıra teknolojileri.
Placnet'in girişi, bir dizi contig ve bir veya daha fazla SAM dosyasıdır.
contig'lere karşı okur. Placnet, Cytoscape'de kolayca açılan bir dizi dosya alır
yazılım veya diğer ağ araçları.
SEÇENEKLER
inputDosya Şablonu Yaz
plaknet -oluşturmak
ağ süreci
plaknet -f girdiDosyası.txt -p önek -l dk
-f=s PLACNET analizi için girdi dosyası.
-p=s Çıktı dosyaları için önek adı (varsayılan 'placnet').
-l=s İskele işlemine minimum bitiş uzunluğu (varsayılan '200').
onworks.net hizmetlerini kullanarak placnet'i çevrimiçi kullanın
