Bu TransDecoder.LongOrfs komutu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan biri kullanılarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen komuttur.
Program:
ADI
Transdecoder.LongOrfs - Transkriptome Protein Tahmini
KULLANIM
gerekli:
-T transkriptler.fasta
İsteğe bağlı:
-m minimum protein uzunluğu (varsayılan: 100)
-G genetik kod (varsayılan: evrensel; bkz. PerlDoc; seçenekler: Euplotes, Tetrahymena, Candida, Acetabularia)
-S diziye özel (yalnızca üst diziyi analiz eder)
Genetik Kodları
Görmekhttp://golgi.harvard.edu/biolinks/gencode.html>. Bunlar şu anda desteklenmektedir:
evrensel (varsayılan)
Evuplotlar
tetrahymena
Candida,it
Asetabularia
Mitokondriyal-Kanonik
Mitokondriyal-Omurgalılar
Mitokondriyal-Eklem bacaklılar
Mitokondriyal-Echinoderms
Mitokondriyal Yumuşakçalar
Mitokondriyal-Asidiyenler
Mitokondriyal Nematodlar
Mitokondriyal-Platyhelmintler
Mitokondriyal Mayalar
Mitokondriyal-Euscomycetes
Mitokondriyal-Protozoanlar
2015-12-28 TRANSDECODER.LONGORFS(1)
Onworks.net hizmetlerini kullanarak TransDecoder.LongOrfs'u çevrimiçi kullanın
