GoGPT Best VPN GoSearch

OnWorks favicon'u

TransDecoder.Predict - Bulutta Çevrimiçi

TransDecoder.Predict'i Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü üzerinden OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırın

Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen TransDecoder.Predict komutudur.

Program:

ADI


Transkoder - Transkriptome Protein Tahmini

KULLANIM


gerekli:

-T transkriptler.fasta

Ortak seçenekler:

--retain_long_orfs bu birçok nükleotitten eşit veya daha uzun bulunan tüm ORF'leri saklayın, başka bir kanıt olmasa bile
kodlama olarak işaretler (varsayılan: 900 bp => 300aa)

--retain_pfam_hits /path/to/pfam_db.hmm aramak için
hmmscan kullanarak (PATH ayarınızdan erişilebilir olmalıdır)

--retain_blastp_hits

Gelişmiş seçenekler

--tren Protein tanımlaması için Markov Modunu eğitmek için ORF'leri içeren FASTA dosyası; aksi halde
kullanılan en uzun yedeksiz ORF'ler

-T --train yoksa, Markov Modelini eğitmek için en uzun ORF'ler (heksamer istatistikleri) (varsayılan: 500)

2015-12-28 TRANSDEKODER.ÖNCELİK(1)

Onworks.net hizmetlerini kullanarak TransDecoder.Predict'i çevrimiçi kullanın


Ücretsiz Sunucular ve İş İstasyonları

Windows ve Linux uygulamalarını indirin

Linux komutları

Ad




×
reklâm
❤️Buradan alışveriş yapın, rezervasyon yapın veya satın alın; ücretsizdir, hizmetlerin ücretsiz kalmasına yardımcı olur.