Bu, en son sürümü GMATAv2.2.jar olarak indirilebilen Genomic SSR işaretçisi için GMATA yazılımı adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
Ücretsiz olarak OnWorks ile Genomic SSR marker için GMATA yazılımı adlı bu uygulamayı çevrimiçi indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
Genomik SSR işaretçisi için GMATA yazılımı
TANIM
GMATA v21 yazılımı nedir
Genom-wide Microsatellite Analyzing Toward Application (GMATA), Basit Dizi Tekrarları (SSR) analizleri ve herhangi bir DNA dizisinde SSR işaretleyici tasarımı ve haritalaması için bir yazılımdır. Aşağıdaki işlevlere sahiptir:
1. SSR madenciliği;
2. İstatistiksel analiz ve çizim;
3. SSR loci grafik görüntüleme;
4. Marker tasarımı;
5. Elektronik haritalama ve işaret aktarılabilirliği araştırması.
GMATA doğru, hassas ve hızlıdır. Büyük genomik dizi veri setlerini, özellikle büyük bütün genom dizilerini işlemek için tasarlanmıştır. Teoride, herhangi bir boyuttaki genomlar GMATA ile kolayca analiz edilebilir. Yazılım GMATA sunucuda, masaüstünde ve hatta dizüstü bilgisayarda çalışır ve sadece tıklamalarla grafik arayüzde çalışabilir veya komut satırında veya otomatikleştirilmiş boru hattında çalıştırılabilir. Aynı zamanda çapraz platformdur ve Unix/Linux, Win ve Mac'i destekler. GMATA yazılımından elde edilen sonuçlar, Gbrowser'da genom veya gen özellikleriyle doğrudan grafiksel olarak görüntülenebilir ve herhangi bir genomik veritabanıyla kolayca entegre edilebilir.
Özellikler
- Herhangi bir büyük dizide doğru ve en hızlı SSR madenciliği
- Komple istatistiksel analiz ve çizim
- Gbrowser'da genom özellikleriyle görüntülenen SSR loci ve işaretçi grafiği
- Spesifik SSR marker tasarımı ve simüle edilmiş PCR
- Elektronik haritalama ve işaretleyici aktarılabilirlik araştırması
- ayrıca şu adresten de bulunabilir: https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
Bu, https://sourceforge.net/projects/gmata/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.