Bu, en son sürümü lr2rmats-v2-alpha.tar.gz olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalışacak lr0.1rmats adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için lr2rmats adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
lr2rmats Linux'ta çevrimiçi çalışacak
AÇIKLAMA
lr2rmats, gelişmiş bir gen açıklama dosyası oluşturmak için hem üçüncü nesil uzun okuma hem de ikinci nesil kısa okuma RNA-seq verilerini kullanmak üzere tasarlanmış Snakemake tabanlı hafif bir boru hattıdır. Yeni oluşturulan açıklama dosyası, diferansiyel alternatif ekleme analizi için rMATS'a sağlanabilir.Daha fazla bilgiye şu adresten ulaşabilirsiniz: https://sourceforge.net/p/lr2rmats/wiki/Home/
Özellikler
- Uzun okuma
- RNA seq
- Alternatif ekleme
- Pasifik Biyobilimleri
- Oxford Nanopore Teknolojileri
Seyirci
Bilim araştırması
Kullanıcı arabirimi
Komut satırı
Programlama dili
Unix Kabuk, Python, C
Bu, https://sourceforge.net/projects/lr2rmats/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
