Bu, en son sürümü NOFI-ranking_v1.zip olarak indirilebilen, Linux'ta çevrimiçi çalışacak NOFI sıralaması adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile ücretsiz olarak Linux'ta çalıştırmak için NOFI sıralaması adlı bu uygulamayı çevrimiçi indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
NOFI sıralaması Linux'ta çevrimiçi çalışacak
Ad
AÇIKLAMA
NOFI sıralama algoritması, girişimden etkilenen parça iyonlarına düşük öncelik atamak için geliştirilmiştir. Uygulama, özelleştirilebilen bir R betiğidir. Gelecekteki bir sürüm, modüler bir sürüm içerecektir. Anahat aşağıdaki gibidir:1) Girdi, Skyline ve OpenSWATH gibi yazılım araçları tarafından tanımlanan ve nicelenen peptitlerden SWATH fragmanı iyon XIC'lerinin listesini içerir.
2) NOFI'deki ilk adım, her bir fragman iyonunu bir vektör olarak temsil etmek için kullanılan 4 özelliğin (RTd, FWHMd, IRd ve IRrep) hesaplanmasıdır.
3) Her bir peptitten tüm fragman iyonlarını sıralamak için çok değişkenli aykırı değer saptama teknikleri kullanılır.
4) Top-N fragman iyonlarının farklı göstergeler üzerindeki etkisini görselleştirmek için birkaç şekil (bir pdf dosyası) oluşturulur.
5) Kullanıcı, peptit başına üst fragman iyonlarının sayısını seçebilir, böylece, bozulmuş fragman iyonlarını hariç tutarken niceleme için yüksek öncelikli Top-N NOFI'lerin optimal alt kümesini kullanabilir.
Seyirci
Bilim araştırması
Programlama dili
B / R
Bu, https://sourceforge.net/projects/nofiranking/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
