Bu, en son sürümü Pontos-3.0.jar olarak indirilebilen, çevrimiçi Linux'ta çalışacak Pontos adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
OnWorks ile çevrimiçi olarak Linux'ta çalıştırmak için Pontos adlı bu uygulamayı çevrimiçi olarak indirin ve çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
Pontos çevrimiçi olarak Linux'ta çalışacak
TANIM
Pontos, PHYLIP formatında DNA dizi hizalamalarından düzeltilmemiş uzaklık (veya benzerlik) matrislerinin hesaplanması için kullanımı kolay, grafiksel bir Java programıdır. Ayrıca normal hizalamalardan "farklı" hizalamalar yaratır (ve tam tersi).Boşlukları ve belirsizlikleri farklı şekillerde ele alabilir.
Boşluklar şunlar olabilir:
- hepsi kullanılmış;
- hepsi göz ardı edildi;
- çiftler halinde yalnızca dizilerin sonunda yoksayılır;
- yalnızca uçlarda yoksayılır, ancak şimdi küresel olarak (aslında tüm hizalamayı uçlardan en uzak dizilere kırparak).
Belirsizlikler (DNA dizisindeki R, Y, N, W vb. şeyler) şu şekilde ele alınabilir:
- belirsizlikleri her zaman farklı olarak düşünün;
- belirsizliği kısmen farklı olarak düşünün (örneğin, R, A veya G'den 0.5 farklı olacaktır);
- her ikili karşılaştırmada belirsizlikleri göz ardı edin;
- herhangi bir belirsizliği gösteren küresel olarak tüm sütunları kaldırın.
Pontos, Linux'ta yazılmıştır, ancak Java'nın çalıştığı herhangi bir sistemde çalışmalıdır. Pontos, GPL sürüm 3 kapsamında lisanslanmıştır.
Seyirci
Bilim/Araştırma, Son Kullanıcılar/Masaüstü
Kullanıcı arabirimi
Java Salıncak
Programlama dili
Java
Bu, https://sourceforge.net/projects/pontos/ adresinden de getirilebilen bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
