Це команда aevol_propagate, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
aevol - експериментальна еволюційна платформа in silico
СИНТАКСИС
aevol_propagate -h or --допомога
aevol_propagate -V or -- версія
aevol_propagate [-v] [-g ГЕНЕР] [-i INDIR] [-o OUTDIR] [-S ГЕНЕРАЛЬНЕ НАСІННЯ]
aevol_propagate [-v] [-g ГЕНЕР] [-i INDIR] [-o OUTDIR] [-s SELSEED] [-m МУСІД] [-t
STOCHSEED] [-e ENVVARSEED] [-n ENVNOISESEED]
ОПИС
Aevol це платформа для моделювання, яка дозволяє дозволяти популяції цифрових організмів
еволюціонувати в різних умовах і експериментально вивчати механізми, що відповідають за це
структура геному та транскриптому.
aevol_propagate
створює свіжу копію експерименту, як це було в даному поколінні. The
номер генерації копії буде скинуто до 0. Якщо ви використовуєте aevol_propagate
багаторазово, щоб ініціалізувати кілька симуляцій, ви повинні вказати інше початкове значення
для кожного моделювання, інакше всі симуляції дадуть точно однакові результати.
Для цього можна скористатися опцією -S. У цьому випадку будуть випадкові малюнки
різні для всіх випадкових процесів, включених у ваші симуляції (мутації,
стохастична експресія генів, відбір, міграція, зміна середовища,
екологічний шум). Як варіант, можна змінити випадкові малюнки на конкретні
лише випадкові процеси, використовуйте не -S, а параметри -m, -s, -t, -e, -n (див.
нижче).
ВАРІАНТИ
-h, --допомога
надрукувати довідку, а потім вийти
-V, -- версія
надрукувати номер версії, а потім вийти
-v, -багатослівний
бути багатослівним
-g, --генер ГЕНЕР
вкажіть номер генерації (за замовчуванням: міститься у файлі last_gener.txt, якщо є)
-я, --в INDIR
вказати вхідний каталог (за замовчуванням ".")
-о, -- вихід OUTDIR
вказати вихідний каталог (за замовчуванням "./output")
-S, -- загальне насіння ГЕНЕРАЛЬНЕ НАСІННЯ
вказати ціле число, яке буде використовуватися як початкове число для випадкових чисел. Якщо ви використовуєте
aevol_propagate кілька разів, щоб ініціалізувати кілька симуляцій, вам слід вказати a
різне насіння для кожного моделювання, інакше всі симуляції дадуть урожай
точно такі ж результати. Якщо ви вкажете це загальне насіння, будуть випадкові малюнки
різні для всіх випадкових процесів, включених у ваші симуляції (мутації,
стохастична експресія генів, відбір, міграція, зміна середовища,
екологічний шум). Щоб змінити випадкові малюнки для певного випадкового процесу
Тільки не використовуйте -S, а наведені нижче параметри.
-так, --сель-насіння SELSEED
вкажіть ціле число як початкове число для випадкових чисел, необхідних для вибору та міграції
(якщо увімкнено просторову структуру).
-м, -- мутне насіння МУСІД
вкажіть ціле число як початкове число для випадкових чисел, необхідних для мутацій.
-t, --сточ-насіння STOCHSEED
вкажіть ціле число як початкове число для випадкових чисел, необхідних для стохастичного гена
вираз.
-е, --env-var-seed ENVVARSEED
вкажіть ціле число як початкове значення для випадкових чисел, необхідних для зміни середовища.
-n, --env-noise-seed ENVNOISESEED
вкажіть ціле число як початкове значення для випадкових чисел, необхідних для шуму навколишнього середовища.
Використовуйте aevol_propagate онлайн за допомогою служб onworks.net
