Це команда bowtie2-inspect, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS.
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
bowtie2-inspect - обгортка для індексу bowtie2-inspect-*
СИНТАКСИС
краватка-метелик2-огляд [опції]*
ОПИС
Краватка-метелик 2 версія 2.2.6 від Бена Ленгміда ([захищено електронною поштою], www.cs.jhu.edu/~langmea)
bt2 ім’я файлу мінус .1.bt2/.2.bt2
За замовчуванням друкує записи FASTA про індексовані нуклеотидні послідовності до стандарту
поза. З -n, просто друкує імена. З -s, просто друкує підсумок індексу
параметри та послідовності. З -e, зберігає кольори, якщо це можливо.
ВАРІАНТИ
--великоіндексний
примусова перевірка «великого» індексу, навіть якщо присутній «малий».
-a/--поперек
Кількість символів у виводі FASTA (за замовчуванням: 60)
-n/--імена
Друкувати лише назви опорних послідовностей
-s/--підсумок
Роздрукувати резюме, вкл. імена посилань, довжини, властивості індексу
-e/--bt2-ref
Відновити посилання з .bt2 (повільно, зберігає кольори)
-v/--дослівно
Детальний вихід (для налагодження)
-h/--допомога
роздрукувати детальний опис інструменту та його опцій
--допомога роздрукувати це повідомлення про використання
Використовуйте bowtie2-inspect онлайн за допомогою служб onworks.net
