Це команда cmtk-glm, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
glm - Загальна лінійна модель
СИНТАКСИС
glm [параметри] ctlfile imgfile_pattern [ctlfile imgfile_pattern ...]
ОПИС
Статистичне моделювання інтенсивності пікселів у кількох зображеннях за допомогою загальної лінійної моделі.
Незалежні змінні моделі визначаються в одному з кількох керуючих файлів. Кожен
контрольний файл — це текстовий файл з одним розділеним пробілом стовпцем на кожну незалежну змінну.
Перший рядок керуючого файлу визначає імена змінних, тобто мітки, які
визначити кожну змінну. Кожен наступний рядок містить одне значення для кожної незалежної змінної.
приклад:
ID віку статі
01 20 0
02 30 1
Кожне ім’я контрольного файлу супроводжується шаблоном імені файлу. У цьому шаблоні один "%s"
заповнювач замінюється значенням, знайденим у першому стовпці кожного рядка контрольного файлу.
Отриманий рядок є шляхом до прочитаного зображення та пов’язаного зі змінними моделі
зазначено в цьому конкретному рядку контрольного файлу.
Використовуючи наведений вище приклад контрольного файлу, шаблон 'images/subject%s.nii' розгорнеться до
імена файлів зображень 'images/subject01.nii' та 'images/subject02.nii'.
Можна використовувати кілька контрольних файлів, кожен з яких має різний шаблон файлу зображення.
ВАРІАНТИ
Глобальний Інструментарій Опції (ці він має загальні by всі CMTK інструменти)
--допомога
Запишіть список основних параметрів командного рядка до стандартного виводу.
--допомога-всім
Запишіть повний список основних і розширених параметрів командного рядка до стандартного виводу.
--вікі
Запишіть список параметрів командного рядка до стандартного виводу в розмітці MediaWiki.
-- чоловік
Запишіть джерело сторінки керівництва в розмітці 'nroff' до стандартного виводу.
-- версія
Записати версію набору інструментів у стандартний вихід.
--луна
Запишіть поточний командний рядок у стандартний вихід.
--розширений рівень
Встановити рівень детальності.
-багатослівний, -v
Збільшити рівень детальності на 1 (не рекомендовано; підтримується для зворотної сумісності).
--нитки
Встановити максимальну кількість паралельних потоків (для потоків POSIX і OpenMP).
вхід Налаштування
--урожай , -c
Щоб заощадити простір/час, обріжте зображення: x0,y0,z0,x1,y1,z2
Модель Налаштування
-- нормалізувати, -n
Нормалізація параметрів моделі щодо відхилень даних.
--експер, -e
Використовуйте експоненціальну модель, а не лінійну.
вибір of Незалежний Змінні
--exclude-constant, -x
Виключити автоматичний постійний параметр з моделі.
--ігнорувати-параметр , -i
Ігнорувати параметр із заданим ЧИСЛОМ (0..n-1). Можна повторити.
--select-параметр , -s
Виберіть параметр із заданою NAME для моделі. Можна повторити.
Вихід Налаштування
--шаблон вихідних даних , -O
Шаблон імені файлу для виведення.
%s замінено типом зображення ('fstat', 'tstat' або 'param')
%d замінено номером незалежної змінної (0 для всієї моделі)
%s замінено на незалежну назву змінної ("модель" для всієї моделі)
[За замовчуванням: модель_%s_%02d_%s.nii ]
AUTHORS
Торстен Ролфінг за участю Майкла П. Хасака, Грега Джеффріса, Келвіна Р.
Маурер, Даніель Б. Руссаков, Ярослав Гальченко
Використовуйте cmtk-glm онлайн за допомогою служб onworks.net
