Це команда cmtk-interleaved_bad_slices, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн- емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
interleaved_bad_slices - Знайдіть погані фрагменти в часовому ряді зображень з чергуванням (наприклад,
серія фМРТ у стані спокою).
СИНТАКСИС
interleaved_bad_slices Шляхи зображень
ОПИС
Цей інструмент зчитує часові ряди 3D-зображень і виявляє відхилення.
ВАРІАНТИ
Глобальний Інструментарій Опції (ці він має загальні by всі CMTK інструменти)
--допомога
Запишіть список основних параметрів командного рядка до стандартного виводу.
--допомога-всім
Запишіть повний список основних і розширених параметрів командного рядка до стандартного виводу.
--вікі
Запишіть список параметрів командного рядка до стандартного виводу в розмітці MediaWiki.
-- чоловік
Запишіть джерело сторінки керівництва в розмітці 'nroff' до стандартного виводу.
-- версія
Записати версію набору інструментів у стандартний вихід.
--луна
Запишіть поточний командний рядок у стандартний вихід.
--розширений рівень
Встановити рівень детальності.
-багатослівний, -v
Збільшити рівень детальності на 1 (не рекомендовано; підтримується для зворотної сумісності).
--нитки
Встановити максимальну кількість паралельних потоків (для потоків POSIX і OpenMP).
вхід Опції
--орієнтація на фрагменти
Визначте орієнтацію зрізів дифузійних зображень. Підтримувані значення: "axial",
"сагітальний", "корональний", "зріз-x", "зріз-y", "зріз-z", де за замовчуванням є "осьовий",
або скористайтеся одним із наступних способів:
--осьова
Осьові зрізи [Це is за замовчуванням]
--сагітальний
Сагітальні зрізи
-- вінцевий
Вінцеві зрізи
--зріз-х
Вісь координат X є напрямком зрізу
--slice-y
Координатна вісь Y є напрямком зрізу
--slice-z
Вісь координат Z є напрямком зрізу [Це is за замовчуванням]
поганий Скибочка Виявлення
--метричний
Показник подібності зображення до зображення для порівняння сусідніх фрагментів. Підтримувані значення:
"ncc", "rms", де за замовчуванням є "ncc", або скористайтеся одним із наступних:
--ncc
Нормована перехресна кореляція. [Це is за замовчуванням]
--середньоквадратичне значення
Корень середніх квадратів різниць.
--stdev-thresh
Порогове значення для поганої ідентифікації зрізу в одиницях стандартних відхилень інтенсивності перевищено
всі відповідні зрізи з решти дифузійних зображень. [За замовчуванням: 3]
Вихід Опції
--погано-скибки-молотити
Мінімальна кількість виявлених поганих фрагментів перед повідомленням про том (лише кількість
У цьому випадку повідомляється про виявлені погані фрагменти, а не про кожен зріз окремо).
[За замовчуванням: 0]
AUTHORS
Торстен Ролфінг за участю Майкла П. Хасака, Грега Джеффріса, Келвіна Р.
Маурер, Даніель Б. Руссаков, Ярослав Гальченко
Використовуйте cmtk-interleaved_bad_slices онлайн за допомогою служб onworks.net
