Це команда fastq-join, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
fastq-join - ea-utils: об'єднати два читання парних кінців на кінцях, що перекриваються
СИНТАКСИС
fastq-приєднання [опції] [mate.fq] -o
ОПИС
fastq-join: недійсний параметр -- 'h' Невідомий параметр `-h'.
З’єднує два зчитування парних кінців на кінцях, що перекриваються.
ВАРІАНТИ
-o FIL Див. «Вихід» нижче -v C Перевіряє, чи збігаються ідентифікатори зонда 2 файлів до
символ C
використовуйте ' ' (пробіл) для читання Illumina
-p N N-відсоткова максимальна різниця (8) -m N N-мінімальне перекриття (6) -r FIL
Детальний звіт про довжину стібка -R Немає зворотного доповнення -x Дозволити вставлення
довжина читання
вихід:
Ви можете поставити 3 -o аргументи для файлів un1, un2, об’єднати файли або один
аргумент як шаблон імені файлу. Суфікс "un1, un2 або join" додається до файлу,
або вони замінюють символ %, якщо він присутній.
Якщо є вхідний файл "mate" (читання штрих-коду), то файли
"un3" і "join2" також створюються.
Використовуйте fastq-join онлайн за допомогою служб onworks.net