Це команда fpromlke, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
fpromlk - Філогенія білка за максимальною ймовірністю
СИНТАКСИС
fpromlk - послідовність seqsetall -intreefile дерево [-категорії ціле] -швидкість масив
-категорії властивості [- ваги властивості] - довжини boolean [-модель список]
[-гама список] -гамакоефіцієнт плавати -ngammacat ціле -інвариантний коефіцієнт плавати
-ninvarcat ціле -інварфрак плавати -nhmmкатегорії ціле -хммрейт масив
-хм імовірності масив -adjsite boolean -лямбда плавати - переплутати ціле
- насіння ціле - глобальна boolean [-аутгрно ціле] - вихідний файл вихідний файл [-форель переключитися]
- вихідний файл вихідний файл [-друк даних boolean] [- прогрес boolean] [- відбиток дерева boolean]
[-гіпстат boolean]
fpromlk -допомога
ОПИС
fpromlk — це програма командного рядка від EMBOSS («Європейська молекулярна біологія Open
Пакет програмного забезпечення»). Це частина командної групи (груп) «Філогенія:Молекулярна послідовність».
ВАРІАНТИ
вхід розділ
- послідовність seqsetall
Файл, що містить одне або кілька вирівнювань послідовності
-intreefile дерево
-категорії ціле
Значення за замовчуванням: 1
-швидкість масив
-категорії властивості
- ваги властивості
Додатковий розділ
- довжини boolean
Значення за замовчуванням: N
-модель список
Значення за замовчуванням: Джонс-Тейлор-Торнтон
-гама список
Значення за замовчуванням: n
-гамакоефіцієнт плавати
Значення за замовчуванням: 1
-ngammacat ціле
Значення за замовчуванням: 1
-інвариантний коефіцієнт плавати
Значення за замовчуванням: 1
-ninvarcat ціле
Значення за замовчуванням: 1
-інварфрак плавати
Значення за замовчуванням: 0.0
-nhmmкатегорії ціле
Значення за замовчуванням: 1
-хммрейт масив
Значення за замовчуванням: 1.0
-хм імовірності масив
Значення за замовчуванням: 1.0
-adjsite boolean
Значення за замовчуванням: N
-лямбда плавати
Значення за замовчуванням: 1.0
- переплутати ціле
- насіння ціле
Значення за замовчуванням: 1
- глобальна boolean
Значення за замовчуванням: N
-аутгрно ціле
Вихід розділ
- вихідний файл вихідний файл
-форель переключитися
Значення за замовчуванням: Y
- вихідний файл вихідний файл
-друк даних boolean
Значення за замовчуванням: N
- прогрес boolean
Значення за замовчуванням: Y
- відбиток дерева boolean
Значення за замовчуванням: Y
-гіпстат boolean
Значення за замовчуванням: N
Використовуйте fpromlke онлайн за допомогою служб onworks.net
