Це команда fsl-5.0-core, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
fsl - інструменти аналізу для FMRI, MRI та DTI візуалізації мозку
ОПИС
FSL — це повний набір інструментів для аналізу даних медичної візуалізації мозку. Це
надає інструменти для попередньої обробки даних, вилучення мозку, реєстрації зображень, а також а
широкий спектр статистичних аналізів. FSL забезпечує простий у використанні графічний інтерфейс.
FSL вимагає правильного встановлення ряду змінних середовища. Щоб досягти цього,
будь ласка, перейдіть до скрипту конфігурації з /etc/fsl/5.0/fsl.sh. Один із способів зробити це
автоматично означає додати рядок, що містить
. /etc/fsl/5.0/fsl.sh
у файл .bashrc у домашньому каталозі користувача (або відповідний файл для інших оболонок
ніж bash). Можливо, спочатку потрібно створити такий файл.
Крім того, пакет Debian встановлює символічні посилання для всіх інструментів FSL / usr / bin Що
подбайте про автоматичне завантаження відповідної конфігурації. Назви символічних посилань є
з префіксом відповідного FSL версії, щоб запобігти конфліктам імен файлів і дозволити
кілька версій для співіснування в одній системі. Наприклад, ломбар команда є
доступний як fsl5.0-слайсер. Зверніть увагу, що для використання FSL інструменти через ці символічні посилання
НЕ необхідно виконати описану вище процедуру налаштування. Однак ця зручність
функція є специфічною для Debian. Скрипти, які використовують команди FSL і призначені для спільного використання
інші повинні покладатися на імена команд без префіксів і змінну середовища FSL
налаштування.
Команда FSL користувальницький інтерфейс іноді посилається на an FSLDIR. У системах Debian це є
/usr/share/fsl/5.0 для FSL версії 5.0.
FSL документацію та онлайн-довідку надається fsl-5.0-doc пакет.
Питання щодо використання FSL або пов'язана теорія може бути розміщена на FSL розсилки
список (Див. http://www.jiscmail.ac.uk/lists/fsl.html).
ПАРАЛЕЛІЗАЦІЯ
FSL можна налаштувати для надсилання завдань на запущений Sun Gridengine (SGE). Поки не всі
функціональність, реалізована в FSL, підтримує цей вид розпаралелювання, найбільш вимогливий
інструменти обробки (наприклад POSSUM і FDT) роблять.
FSL повинен мати можливість використовувати SGE, навіть якщо змінна середовища SGE_ROOT не встановлена, як в
випадок з пакетом Debian SGE. Щоб увімкнути пакетну обробку, просто встановіть
FSLPARALLEL=1
в оболонці, де працює FSL. Це можна ввімкнути постійно в
/etc/fsl/5.0/fsl.sh
або в кожному конкретному випадку.
Використовуйте fsl-5.0-core онлайн за допомогою служб onworks.net
