gdcm2vtk - онлайн у хмарі

ПРОГРАМА:

ІМ'Я

gdcm2vtk - Перетворення файлу, який підтримує VTK, у DICOM.

СИНТАКСИС

gdcm2vtk [параметри] файл-вхід файл-вихід

ОПИС

Команда gdcm2vtk приймає на вхід будь-який файл, який підтримує VTK (включаючи файл DICOM), і буде
створити як вихідний файл DICOM.

ПАРАМЕТРИ

вхідне ім'я файлу (підтримується DICOM або VTK)

вихідна назва файлу (підтримується DICOM або VTK)

ВАРІАНТИ

конкретний опції
--force-rescale сила масштабування.
--сила-рознос силовий інтервал.
--palette-color, якщо підтримується, створити файл PALETTE COLOR.
--argb, якщо підтримується, створити файл ARGB.
--compress, якщо підтримується, створити стиснутий файл.
--use-vtkdicom Використовуйте vtkDICOMImageReader (замість GDCM).
--modality встановити Модальність.
--нижній лівий набір нижній лівий.
--зміна набір зміна.
--масштаб набір масштабу.
-- стиснення набору (MetaIO).
-T --study-uid UID дослідження.
-S --series-uid UID серії.
--root-uid Кореневий UID.

стиснення опції
-J --jpeg Стиснути зображення у форматі jpeg.
-K --j2k Стиснути зображення в j2k.
-L --jpegls Стиснути зображення в jpeg-ls.
-R --rle Стиснути зображення в rle (тільки без втрат).

загальний опції
-h --допомога
роздрукувати цей текст довідки та вийти

-v --версія
роздрукувати інформацію про версію та вийти

-V --дослівно
докладний режим (попередження+помилка).

-W --попередження
режим попередження, друк попереджувальної інформації

-E --помилка
режим помилки, роздрукувати інформацію про помилку

-D --налагодження
режим налагодження, друк налагоджувальної інформації

навколишнє середовище змінна
GDCM_ROOT_UID Кореневий UID

ОПИС

Перетворіть файл, який підтримує VTK, у DICOM.

Типове використання:

$ gdcm2vtk вхідний файл output.dcm

Він використовує внутрішній заводський механізм VTK для розпізнавання файлу (функція CanRead). Побачити
Файл, який підтримується VTK тут:

Які формати файлів зображень може читати та записувати VTK? http://www.vtk.org/Wiki/VTK_FAQ#What_image_file_formats_can_VTK_read_and_write.3F

Якщо ваш вхідний файл містить 4 компоненти, 4-й комп’ютер (альфа) буде видалено з виводу
файл, оскільки DICOM більше не підтримує альфа-компонент (див. параметр –argb).

Особливу увагу було приділено такому формату файлу:

1. DICOM: косинус напряму та vtkMedicalImageInformation передаються на вихід
2. BMP: файл можна зберегти за допомогою таблиці пошуку (див. --palette-color)
3. GE Signa: vtkMedicalImageProperties передається на вихід
4. MINC: Косинус напряму передається на вихід
5. TIFF: vtkTIFFReader зараз у поганому стані у VTK (інша поведінка у VTK 5.2 та git/master). Користуйтеся ним, тільки якщо знаєте, що робите.

CONVERT MetaImage (mhd, мга)
$ gdcm2vtk вхідний файл output.mha

Ця команда перетворить вхідний файл DICOM: inputfile у файл MetaImage .mha. Те саме
підходить для файлу .mhd.

CONVERT MHA/MHD
$ gdcm2vtk вхідний файл output.mha

or

$ gdcm2vtk вхідний файл output.mhd

Ця команда перетворить вхідний файл DICOM: inputfile у MetaImageData .mha/.mhd
файлу.

CONVERT VTI
$ gdcm2vtk вхідний файл output.vti

Ця команда перетворить вхідний файл DICOM: inputfile у XML VTK ImageData .vti
файлу.

CONVERT ВТК
$ gdcm2vtk вхідний файл output.vtk

Ця команда перетворить вхідний файл DICOM: inputfile у старий VTK Structured
Файл PointSets .vtk.

CONVERT DICOM

$ gdcm2vtk input.dcm output.dcm

vtkGDCMImageReader буде використовуватися для читання файлу DICOM, а не за замовчуванням
vtkDICOMImageReader. Перегляньте параметр –use-vtkdicom, щоб використовувати vtkDICOMImageReader.

ТУДИ Й НАЗАД DICOM TO MHD TO DICOM

$ gdcm2vtk input_ybr.dcm output.mhd
$ gdcm2vtk --modality US --imageformat 7 output.mhd output.dcm

У наведеному вище розділі показано, як конвертувати DICOM за допомогою фотометричної інтерпретації
YBR_FULL (або навіть YBR_FULL_422 з втратами) в інший формат файлу: MetaImage (mhd). Так як
цей формат файлу не обробляє колірний простір, ми повинні явно встановити його за допомогою
– параметр командного рядка imageformat. Для цього необхідний параметр командного рядка –modality
оскільки сімейство класів зберігання вторинних зображень за замовчуванням не допускає YBR
Фотометрична інтерпретація.

GDCM2VTK ПРИМІТКИ

ВАЖЛИВА ПРИМІТКА: Внутрішня структурована VTK буде заповнена з входу DICOM, а потім
перейти до вихідного запису DICOM. Деяка інформація може бути втрачена під час перетворення
DICOM в VTK в DICOM. Цей параметр в основному використовується для перевірки
Комбінація vtkGDCMImageReader/vtkGDCMImageWriter.

ВАЖЛИВА ПРИМІТКА. Під час конвертації з формату з втратами, наприклад JPEG, інформація про
втрата важлива. Вихідний DICOM міститиме необхідне зображення з втратами
Атрибут стиснення, який вказує на те, що зображення було стиснуто з втратами десь уздовж
трубопровід. Дивіться також gdcmimg (краща робота з JPEG загалом).

ВАЖЛИВА ПРИМІТКА. При використанні –use-vtkdicom вихідний файл DICOM завжди буде записаний як
MR Image Storage, оскільки ця інформація недоступна з самого зчитувача. Це дозволяє
правильно налаштувати орієнтацію зображення (пацієнт).

Використовуйте gdcm2vtk онлайн за допомогою служб onworks.net