Це команда hmm2fetch, яку можна запустити у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks за допомогою однієї з наших безкоштовних онлайн-робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
hmm2fetch - отримати HMM з бази даних HMM
СИНТАКСИС
hmm2fetch [параметри] база даних ім'я
ОПИС
hmm2fetch це невелика утиліта, яка отримує виклик HMM ім'я з бази даних моделі HMMER
званий бази даних. у новому форматі та друкує цю модель у стандартний вихід. Наприклад,
hmm2fetch Pfam ррм отримує модель RRM (мотив розпізнавання РНК) з Pfam, якщо
змінна середовища HMMERDB встановлюється на місце розташування бази даних Pfam. Відновлений
Файл HMM записаний у форматі HMMER 2 ASCII.
База даних повинна мати пов’язаний файл індексу GSI. Щоб індексувати базу даних HMM, використовуйте
програма hmm2index.
ВАРІАНТИ
-h Роздрукувати коротку довідку; включає номер версії та зведення всіх параметрів, в т.ч
експертні варіанти.
-n перекладач ім'я як номер HMM замість імені. Нумерація починається з 0. За
наприклад, щоб отримати перший HMM із бази даних HMM фу, ти зробиш
hmm2fetch -n 0 foo
Використовуйте hmm2fetch онлайн за допомогою сервісів onworks.net