Це команда hmmpress, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS.
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
hmmpress - підготувати базу даних HMM для hmmscan
СИНТАКСИС
hmmpress [параметри]
ОПИС
Починаючи з бази даних профілів у стандартному форматі HMMER3, побудуйте двійковий файл
стислі файли даних для hmmscan, hmmpress крок необхідний для hmmscan працювати.
Створено чотири файли: .h3m, .h3i, .h3f та .h3p.
Команда .h3m файл містить профіль HMM та їх анотацію у двійковому форматі.
Команда .h3i файл є індексом SSI для .h3m файл. The .h3f файл
містить попередньо обчислені структури даних для швидкого евристичного фільтра (фільтр MSV). The
.h3p файл містить попередньо обчислені структури даних для решти кожного профілю.
не може бути "-" (тире); біг hmmpress на стандартний вхідний потік, а не a
файл не дозволений.
ВАРІАНТИ
-h Допомога; надрукувати коротке нагадування про використання командного рядка та всі доступні параметри.
-f Сила; перезаписує будь-які попередні файли даних hmmpress. За замовчуванням — байдикувати
будь-які існуючі файли та попросіть вас спочатку видалити їх.
Використовуйте hmmpress онлайн за допомогою служб onworks.net
