Це команда maf2anchors.pl, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
maf2anchors -- Перетворює файли maf у набори прив'язок Murasaki
СИНТАКСИС
maf2anchors
ВАРІАНТИ
--префікс=
використовувати як префікс для імен вихідних файлів (в іншому випадку використовується )
--розриви=
допустити до розривів.
--fakeseqs
генерувати підроблені файли довжини послідовності та заглушки послідовності на основі даних про довжину послідовності
у файлі MAF
--довіра
довіряйте анотації коментарів, доданій TBA у другому рядку файлу (якщо є)
що в ньому перераховано дерево, яке використовується для вирівнювання, і всі залучені послідовності. Значення за замовчуванням
щоб увімкнути. використовуйте --notrust, щоб не довіряти тегам TBA (технічно ці дані не є частиною
специфікації формату файлу і просто забитий у коментарі, які створює TBA, але
може бути присутнім або не точним у всіх файлах MAF, тому ми надаємо вам можливість
не вірити).
--сортувати
Відсортуйте послідовності, знайдені за допомогою --trust (щоб відповідати вихідним результатам, які б
сталося з --notrust).
Використовуйте maf2anchors.pl онлайн за допомогою служб onworks.net
