Це команда masai_output_pe, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
masai_output_pe - Вихід Масаї - парний кінцевий режим
СИНТАКСИС
masai_output_pe [ПАРАЦІЇ]
ОПИС
Masai — це швидкий і точний картограф для читання, заснований на приблизних і множинних насіннях
повернення назад.
Читати http://www.seqan.de/projects/masai для отримання додаткової інформації.
(c) Авторські права 2011-2012, Енріко Сірагуса.
-h, --допомога
Відображає це повідомлення довідки.
-- версія
Показати інформацію про версію
Параметри створення пари:
-нг, --без пропусків
Не вирівнюйте читання з пробілами.
-ll, --library-leng NUM
Довжина бібліотеки. За замовчуванням: 220.
-The, --бібліотека-помилка NUM
Допуск на довжину бібліотеки. За замовчуванням: 50.
Параметри виведення:
-t, --tmp-папка STR
Вкажіть величезну тимчасову папку. За замовчуванням: використовувати папку генома.
-o, -- вихідний файл Фото
Вкажіть вихідний файл. За замовчуванням: використовуйте префікс назви файлу reads. Допустимі типи файлів
є: raw і sam.
-nc, --без сигари
Не виводити рядок CIGAR. Це впливає лише на вихід SAM.
Параметри налагодження:
-й, --без свалки
Не скидайте результати.
Версія
masai_output_pe версія: 0.7.1 [14053] Останнє оновлення 2013-05-16
Використовуйте masai_output_pe онлайн за допомогою служб onworks.net
