mia-2dmyocard-ica - онлайн в хмарі

ПРОГРАМА:

ІМ'Я

mia-2dmyocard-ica - Виконайте аналіз ICA на серії 2D-зображень

СИНТАКСИС

mia-2dmyocard-ica -i [параметри]

ОПИС

mia-2dmyocard-ica Ця програма використовується для виконання ICA на серії перфузії міокарда
зображення для створення синтетичних посилань, які можна використовувати для корекції руху зображенням
реєстрація. Якщо мета полягає в тому, щоб запустити повну компенсацію руху, то краще створити
набір сегментації та використання mia-2dmyoica-nonrigid. Якщо вхідні дані задаються за допомогою a
набір сегментації, потім можна також використовувати mia-2dmyocard-icaseries. Ця програма є
по суті використовується для тестування різних варіантів запуску ICA для довідкового зображення
створення.

ВАРІАНТИ

-i --in-base=(вхід, обов'язковий); io
ім'я вхідного файлу ім'я шаблону передачі XXXX.ext X=числа Для файлу, який підтримується
типи див. ПЛАГІНИ:2dimage/io

--coefs=
вивести коефіцієнти змішування в цей файл

-o --out-base=(вихід); рядок
База імені вихідного файлу

-t --type=exr
тип вихідного файлу
Підтриманий величини є :( @, BMP, DCM, EXR, JPEG, JPG, PNG, RAW,
TIF, TIFF, V, ПЕРЕГЛЯНУТИ, bmp, dcm, exr, jpeg, jpg, png, сирий, тиф,
сварка, v, вигляд, )

-k --пропуск=2
пропускати зображення на початку серіїПропускати зображення на початку серії

-e --end=60
останнє зображення в серії останнє зображення в серії

-C --components=0
№ компонентів, 0 = оцінка автоматично nr. компонентів, 0=оцінка
автоматично

-m --смужка-середня
видалити середнє зображення із серії

-f --save-features=
зберегти головне зображення

-p --полосково-періодичний
смуга тільки періодичної складової

-x --max-ica-iterations=0
максимальна кількість ітерацій розв’язувача ICAМаксимум ітерацій вирішувача ICA

-n --ica-нормалізувати
ica_normalize зображень функцій

--all-features=
зберегти всі функціональні зображення в

-L --LV-crop-amp=0
Підсилення маски обрізання LV, 0.0 = не обрізати підсилення маски обрізання LV, 0.0
= не обрізати

-a --автокомпоненти
автоматична оцінка кількості компонентів на основі кореляції. Має на увазі
-m і -n (експериментальний)

Документи & інформація
-V --verbose=попередження
детальність виводу, друк повідомлень заданого рівня та вищих пріоритетів.
Підтримувані пріоритети, починаючи з найнижчого рівня:
інформація - Повідомлення низького рівня
простежувати ‐ Трасування виклику функції
невдача - Повідомляйте про помилки тестування
попередження - Попередження
помилка - Повідомити про помилки
відлагоджувати ‐ Вихід налагодження
повідомлення - Звичайні повідомлення
фатальний - Повідомляйте лише про фатальні помилки

-- авторське право
роздрукувати інформацію про авторські права

-h --допомога
роздрукувати цю довідку

-? --використання
надрукувати коротку довідку

-- версія
надрукувати номер версії та вийти

Обробка
--threads=-1
Максимальна кількість потоків для обробки, це число має бути меншим
або дорівнює кількості ядер логічного процесора в машині. (-1:
автоматична оцінка).Максимальна кількість потоків для обробки,Це
число має бути меншим або дорівнювати кількості ядер логічного процесора в
машина. (-1: автоматична оцінка).

ПЛАГІНИ: 2dimage/io

bmp Підтримка введення/виведення 2D-зображень BMP

Розпізнані розширення файлів: .BMP, .bmp

Підтримувані типи елементів:
двійкові дані, 8 біт без знаку, 16 біт без знака

пул даних Віртуальний IO до та з внутрішнього пулу даних

Розпізнані розширення файлів: .@

dicom 2D зображення io для DICOM

Розпізнані розширення файлів: .DCM, .dcm

Підтримувані типи елементів:
зі знаком 16 біт, без знаку 16 біт

exr плагін 2dimage io для зображень OpenEXR

Розпізнані розширення файлів: .EXR, .exr

Підтримувані типи елементів:
без знака 32 біт, з плаваючою комою 32 біт

JPG плагін 2dimage io для зображень у відтінках сірого jpeg

Розпізнані розширення файлів: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Підтримувані типи елементів:
8 біт без знака

PNG плагін 2dimage io для зображень PNG

Розпізнані розширення файлів: .PNG, .png

Підтримувані типи елементів:
двійкові дані, 8 біт без знаку, 16 біт без знака

сировина Підтримка виведення 2D-зображень RAW

Розпізнані розширення файлів: .RAW, .raw

Підтримувані типи елементів:
двійкові дані, 8 біт зі знаком, 8 біт без знака, 16 біт зі знаком, 16 біт без знака,
32 біт зі знаком, 32 біт без знаку, 32 біт з плаваючою комою, 64 з плаваючою комою
біт

tif Підтримка введення/виведення 2D-зображень TIFF

Розпізнані розширення файлів: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Підтримувані типи елементів:
двійкові дані, 8 біт без знаку, 16 біт без знака, 32 біт без знака

перспектива плагін 2dimage io для зображень Vista

Розпізнані розширення файлів: .V, .VISTA, .v, .vista

Підтримувані типи елементів:
двійкові дані, 8 біт зі знаком, 8 біт без знака, 16 біт зі знаком, 16 біт без знака,
32 біт зі знаком, 32 біт без знаку, 32 біт з плаваючою комою, 64 з плаваючою комою
біт

приклад

Оцініть синтетичні посилання з зображень imageXXXX.exr та збережіть їх у refXXXX.exr
за допомогою п’яти незалежних компонентів означають видалення, нормалізацію та пропуск 2 зображень.

mia-2dmyocard-ica -i imageXXXX.exr -o ref -k 2 -C 5 -m -n

АВТОР(и)

Герт Волний

АВТОРСЬКЕ

Авторське право на це програмне забезпечення (c) 1999-2015, Лейпциг, Німеччина та Мадрид, Іспанія. Воно приходить
без АБСОЛЮТНО НІ ГАРАНТІЙ, і ви можете розповсюджувати його відповідно до умов GNU
ЗАГАЛЬНА ПУБЛІЧНА ЛІЦЕНЗІЯ Версія 3 (або новіша). Для отримання додаткової інформації запустіть програму за допомогою
параметр '--copyright'.

Використовуйте mia-2dmyocard-ica онлайн за допомогою служб onworks.net