Це команда TransDecoder.LongOrfs, яку можна запустити у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks за допомогою однієї з наших безкоштовних онлайн-робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
Transdecoder.LongOrfs - Передбачення транскриптомного білка
ВИКОРИСТАННЯ
Вимагається:
-т стенограми.fasta
Додатково:
-м мінімальна довжина протеїну (за замовчуванням: 100)
-Г генетичний код (за замовчуванням: універсальний; див. PerlDoc; варіанти: Euplotes, Tetrahymena, Candida, Acetabularia)
-S специфічний для ланцюга (аналізує лише верхній ланцюг)
Генетичний Codes
Побачитиhttp://golgi.harvard.edu/biolinks/gencode.html>. Наразі підтримуються:
універсальний (за замовчуванням)
Евплоти
тетрагімена
Candida
Ацетабулярія
Мітохондріально-канонічний
Мітохондріально-хребетні
Мітохондріально-Членистоногі
Мітохондріально-Голкошкірі
Мітохондріальні молюски
Мітохондріально-асцидійні
Мітохондріальні нематоди
Мітохондріально-Платигельмінти
Мітохондріальні дріжджі
Мітохондріально-еваскоміцети
Мітохондрії-Протозойні
2015-12-28 ТРАНСДЕКОДЕР.LONGORFS(1)
Використовуйте TransDecoder.LongOrfs онлайн за допомогою сервісів onworks.net
