Це програма для Linux під назвою GenOO-HTS для роботи в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як genoo-code-2013_04_18.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою GenOO-HTS, щоб безкоштовно запускати в Linux онлайн з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
GenOO-HTS для запуску в Linux онлайн
ОПИС
GenOO-HTS [jee-noo] є відкритим вихідним кодом; об'єктно-орієнтований фреймворк Perl, спеціально розроблений для розробки інструментів аналізу високопродуктивного секвенування (HTS). Основна мета GenOO-HTS – зробити простий HTS аналіз легким і можливим складний аналіз. GenOO-HTS моделює біологічні сутності в об’єкти Perl і надає відповідні атрибути та методи, які дозволяють маніпулювати даними високопродуктивного секвенування. Використання GenOO-HTS як основного модуля розробки зменшує накладні витрати та складність керування даними та наявними біологічними об’єктами. GenOO-HTS був розроблений як гнучкий, легко розширюваний завдяки модульній структурі та мінімальним вимогам до зовнішніх інструментів і бібліотек.Функції
- Організуйте біологічні сутності як об’єкти perl (геномні області, гени, транскрипти, інтрони/екзони тощо)
- Організуйте об’єкти послідовності як об’єкти/атрибути perl (читання послідовності, вирівнювання тощо)
- Зробіть ввод-вивод із широко використовуваних форматів файлів простим (SAM, BED, FASTA, FASTQ)
- Будьте послідовними та легко розширюваними
Аудиторія
Наука/Дослідження, Розробники
Мова програмування
Perl
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/genoo/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
