Це програма для Linux під назвою locusvu для роботи в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як LocusVu.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою locusvu для безкоштовного запуску в Linux онлайн з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
locusvu для запуску в Linux онлайн
ОПИС
LocusVu — це новий програмний інструмент на основі Java, який приймає список геномних локусів (положень на хромосомі) як вхідні дані та автоматизує отримання пов’язаної інформації (цитогенетична смуга, назва гена, дані OMIM тощо) з публічних баз даних, таких як браузер геному UCSC. бази даних. Потім він дає змогу виконувати кілька робочих процесів із отриманими результатами, наприклад, порівнювати декілька наборів даних (порівняльна геноміка), переглядати сусідні гени для локусів із самого інструменту або графічно представляти ці результати на стовпчастих/кругових діаграмах. LocusVu має простий, простий у використанні графічний інтерфейс на інтерфейсі, який забезпечує інтуїтивно зрозумілу взаємодію користувача з основною логікою.Інструмент можна легко розширити, щоб додати підтримку інших баз даних (наприклад, Ensembl) або отримати інформацію
з інших таблиць бази даних. Таким чином, LocusVu забезпечує базову структуру, яку можуть використовувати як користувачі, так і розробники для спрощення існуючих робочих процесів і створення нових для підтримки аналізу даних у геноміці.
Функції
- Автоматизує отримання даних з баз даних (зараз база даних браузера геному UCSC)
- Вмикає робочі процеси з отриманими результатами, як-от..
- ..порівняння кількох наборів даних (порівняльна геноміка)
- ..перегляд сусідніх генів для локусу (зсередини самого інструмента)
- ..графічно представляти результати (гістограми / кругові діаграми)
- Простий у використанні графічний інтерфейс інтерфейсу для інтуїтивно зрозумілого використання
- Ведення журналу за допомогою Log4j для легкого налагодження
- Легко розширюваний
Аудиторія
Наука/Дослідження, Розробники
Користувацький інтерфейс
Java Swing
Мова програмування
Java
Середовище бази даних
MySQL
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/locusvu/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
