Це програма для Linux під назвою lr2rmats для роботи в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як lr2rmats-v0.1-alpha.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою lr2rmats для безкоштовного запуску в Linux онлайн з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
lr2rmats для запуску в Linux онлайн
ОПИС
lr2rmats — це легкий конвеєр на основі Snakemake, який розроблений для використання як третього покоління для довгого читання, так і другого покоління короткочитаних даних RNA-seq для створення вдосконаленого файлу анотації генів. Нещодавно згенерований файл анотації може бути наданий rMATS для аналізу диференціального альтернативного сплайсингу.Більше інформації можна знайти на https://sourceforge.net/p/lr2rmats/wiki/Home/
риси
- Довго читали
- РНК-п.п
- Альтернативне зрощення
- Тихоокеанські біологічні науки
- Oxford Nanopore Technologies
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Командний рядок
Мова програмування
Оболонка Unix, Python, C
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/lr2rmats/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
