Це програма для Linux під назвою ParamIT, останню версію якої можна завантажити як ParamITPack-1.0.tar.bz2. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою ParamIT з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
ParamIT
ОПИС
ParamIT — це набір інструментів, який допомагає розробити параметризацію молекулярно-механічного силового поля для малих молекул, подібних до опору, в рамках протоколу загального силового поля CHARMM (CGenFF). Розроблений інструментарій допомагає дослідникам: 1) автоматизувати створення кількох вхідних файлів для програм квантової та молекулярної механіки, 2) автоматизувати вихідний аналіз і 3) замінити використання повноцінних програм ММ більш швидкою спеціалізованою. Розроблені інструменти включають: 1) генератор комплексів молекула-вода з графічним інтерфейсом користувача (GUI), 2) напівавтоматичний частотний аналіз із використанням символьної матриці розподілу потенціальної енергії та порівняння оптимізованих внутрішніх координат, 3) GUI для підбору заряду з трьома режимами. : вручну, вибірка Монте-Карло або груба сила, і 4) GUI для підгонки двогранних термінів. Використання цих інструментів зменшує трудомісткість, зменшує помилки ручного введення та скорочує час, необхідний для точної параметризації ММ.
Аудиторія
Наука/Дослідження
Користувацький інтерфейс
Командний рядок, Tk
Мова програмування
C, Python
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/paramit/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
