Це програма для Linux PolyCTLDesigner для запуску в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як dist_PolyCTLDesigner.0.3.a.zip. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою PolyCTLDesigner для безкоштовного запуску в Linux онлайн з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
PolyCTLDesigner для запуску в Linux онлайн
Ad
ОПИС
Враховуючи пептиди (Т-клітинні епітопи), PolyCTLDesigner вибирає фланкуючі послідовності для оптимізації TAP-зв’язування та з’єднує отримані олігопептиди в поліепітоп таким чином, щоб забезпечити ефективне звільнення потенційних епітопів шляхом протеасомного та/або імунопротеасомного процесингу та мінімізації кількості епітопів з’єднання. Для конструювання поліепітопів PolyCTLDesigner використовує відомі амінокислотні моделі розщеплення протеасоми та специфічність зв’язування TAP. PolyCTLDesigner також може вибирати антигенні пептиди, що охоплюють вибраний репертуар HLA з бажаною швидкістю надмірності. Враховуючи антигенні послідовності, PolyCTLDesigner також здатний відбирати Т-хелперні епітопи. Для прогнозування епітопів Т-клітин він використовує TEpredict.Аудиторія
Наука/Дослідження
Мова програмування
Python
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/polyctldesigner/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
