Це програма для Linux під назвою ProGraphMSA, останню версію якої можна завантажити як ProGraphMSA-20130709.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою ProGraphMSA з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ProGraphMSA
Ad
ОПИС
ProGraphMSA — це сучасний інструмент вирівнювання кількох послідовностей, який створює філогенетично чутливі шаблони розривів, зберігаючи при цьому надійність, допускаючи альтернативні зрощення та помилки в шаблоні розгалуження направляючого дерева. Це досягається шляхом включення представлення послідовності на основі графіка, як у POA, і поєднання його з перевагами алгоритму Prank, що враховує філогенію. Крім того, ми враховуємо варіації в шаблоні заміни, використовуючи оцінені частоти амінокислот і реалізуючи контекстно-специфічні профілі, як у CS-Blast.Останні версії ProGraphMSA включають і розширення моделі вирівнювання для підтримки тандемних вставок і видалення одиниць повторення.
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/prographmsa/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
