Це програма для Linux під назвою SSC, останню версію якої можна завантажити як SSC0.1.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою SSC з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
SSC
Ad
ОПИС
SSC є інструментом для прогнозування ефективності sgRNA із спейсерних послідовностей. Він підтримує застосування оптимізації бібліотек sgRNA в екранах інгібування/активації CRISPR/Cas9 або CRISPR/dCas9.риси
- Вилучення послідовностей-кандидатів пробілів із файлу .fasta
- Спрогнозувати ефективність sgRNA на основі спейсерних послідовностей для дизайну бібліотеки при нокауті CRISPR/Cas9 та інгібуванні або активації CRISPR/dCas9.
- надають матриці, які підтримують: спейсери 19-20 біт/с у нокауті CRISPR/Cas9, оптимізовані для геному людини та миші.
- надають матриці, які підтримують: спейсери 19-21 біт/с у CRISPR/dCas9, оптимізовані для геному людини.
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/spacerscoringcrispr/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.