Це програма для Linux під назвою VCF Explorer для роботи в Linux онлайн, останню версію якої можна завантажити як VCFExplorer.tar.gz. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою VCF Explorer, щоб безкоштовно запускати в Linux онлайн з OnWorks.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
VCF Explorer для запуску в Linux онлайн
ОПИС
Зменшення вартості високопродуктивних технологій призвело до ряду проектів секвенування, що складаються з тисяч цілих геномів. Зміна парадигми від екзома до всього геному призводить до значного збільшення розміру вихідних файлів. Більшість із існуючих інструментів, розроблених для аналізу файлів exome, не придатні для великих файлів VCF, створених дослідженнями цілого геному. У цій роботі ми представляємо VCF-Explorer, програмне забезпечення для аналізу варіантів, здатне обробляти великі файли. Ефективне управління пам'яттю програми та виключення етапу попереднього аналізу дозволяють проводити аналіз на звичайних комп'ютерах. VCF-Explorer представляє просте у використанні середовище, де можна визначити різні типи запитів для анотації та зразків. VCF-Explorer можна запускати в різних середовищах і обчислювальних платформах, починаючи від стандартного ноутбука і закінчуючи розширеним сервером.Функції
- Просте у використанні середовище
- Ефективне управління пам'яттю
- Обробка файлів VCF з великим (весь геном).
- Працює на персональному комп’ютері з обмеженими обчислювальними ресурсами
Користувацький інтерфейс
Qt
Мова програмування
C++, C
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/vcfexplorer/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
