Це програма Windows під назвою MetaPhat -meta-pheno-association-tracker, останню версію якої можна завантажити як plasma_lipids_decomposed.zip. Його можна запустити онлайн у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою MetaPhat -meta-pheno-association-tracker з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть будь-який онлайн емулятор ОС OnWorks з цього веб-сайту, але кращий онлайн-емулятор Windows.
- 5. З ОС OnWorks Windows, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму та встановіть її.
- 7. Завантажте Wine зі сховищ програмного забезпечення дистрибутивів Linux. Після встановлення ви можете двічі клацнути програму, щоб запустити їх за допомогою Wine. Ви також можете спробувати PlayOnLinux, модний інтерфейс замість Wine, який допоможе вам встановити популярні програми та ігри Windows.
Wine — це спосіб запуску програмного забезпечення Windows на Linux, але без використання Windows. Wine — це рівень сумісності Windows з відкритим вихідним кодом, який може запускати програми Windows безпосередньо на будь-якому робочому столі Linux. По суті, Wine намагається повторно реалізувати достатньо Windows з нуля, щоб він міг запускати всі ці програми Windows, насправді не потребуючи Windows.
ЕКРАНИ
Ad
MetaPhat -мета-фено-асоціація-трекер
ОПИС
MetaPhat — це програма з відкритим вихідним кодом для виявлення оптимальних ознак підмножини на провідних асоціаціях SNP за підсумковими результатами GWAS кількох біомаркерів. Найкращі ознаки виводяться шляхом систематичного розкладання багатовимірних асоціацій на центральні ознаки на основі оптимального BIC і P-значення з багатовимірних моделей CCA. Результати відстеження SNP будуються на графіку та кластеризуються для аналізу та покращення специфічності асоціацій фенотип-генотип mv.
випускається з функцією LD https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Швидкий початок https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Quick%20Start
Витрати https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Inputs
Приклад Global Lipids https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Installation_global_lipids
Цит.: Lin et al. (2020) MetaPhat: виявлення та декомпозиція багатовимірних асоціацій із одновимірної загальногеномної статистики асоціацій. Фронт. Жене. зробити: 10.
риси
- багатоваріантний аналіз ознак у всьому геномі
- Оптимальний вибір підмножини ознак на основі p-значення та BIC
- графіки розкладання ознак
- Населення та групування блоків LD
- Зведений файл SNP і драйвера
- snp-snp кластер списоносців
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.