Đây là lệnh bowtie2-inspect có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình mô phỏng trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
bowtie2-inspect - trình bao bọc cho chỉ mục bowtie2-inspect-*
SYNOPSIS
bowtie2-kiểm tra [lựa chọn]*
MÔ TẢ
Bowtie 2 phiên bản 2.2.6 của Ben Langmead ([email được bảo vệ], www.cs.jhu.edu/~langmea)
tên tệp bt2 trừ đi dấu .1.bt2 / .2.bt2
Theo mặc định, in các bản ghi FASTA về trình tự nucleotide được lập chỉ mục theo tiêu chuẩn
ngoài. Với -n, chỉ in tên. Với -s, chỉ in một bản tóm tắt của chỉ mục
tham số và trình tự. Với -e, giữ nguyên màu sắc nếu có.
LỰA CHỌN
--chỉ số phóng to
buộc kiểm tra chỉ số 'lớn', ngay cả khi có chỉ số 'nhỏ'.
-a/--ngang qua
Số ký tự trong đầu ra FASTA (mặc định: 60)
-n/ - tên
Chỉ in tên chuỗi tham chiếu
-s/--tóm lược
In tóm tắt bao gồm. tên tham chiếu, độ dài, thuộc tính chỉ mục
-e/ - bt2-ref
Tạo lại tham chiếu từ .bt2 (chậm, giữ nguyên màu sắc)
-v/ - dài dòng
Đầu ra chi tiết (để gỡ lỗi)
-h/--Cứu giúp
in mô tả chi tiết về công cụ và các tùy chọn của nó
--Cứu giúp in thông báo sử dụng này
Sử dụng bowtie2-inspect trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net
