dcml2pnm - Trực tuyến trên đám mây

CHƯƠNG TRÌNH:

TÊN

dcml2pnm - Chuyển đổi hình ảnh DICOM thành PGM / PPM, PNG, TIFF hoặc BMP

SYNOPSIS

dcml2pnm [tùy chọn] dcmfile-in [bitmap-out]

MÔ TẢ

Sản phẩm dcml2pnm tiện ích đọc hình ảnh DICOM, chuyển đổi dữ liệu pixel theo
các tùy chọn xử lý hình ảnh đã chọn và ghi lại hình ảnh trong PGM / PPM nổi tiếng
(bản đồ xám di động / bản đồ pix di động), định dạng PNG, TIFF hoặc Windows BMP. Tiện ích này
hỗ trợ không nén cũng như các hình ảnh DICOM nén JPEG-LS và RLE.

THÔNG SỐ

dcmfile-in DICOM tên tệp đầu vào sẽ được chuyển đổi

tên tệp đầu ra bitmap-out sẽ được ghi (mặc định: stdout)

LỰA CHỌN

chung lựa chọn
-h - trợ giúp
in văn bản trợ giúp này và thoát

--phiên bản
in thông tin phiên bản và thoát

--tranh luận
in các đối số dòng lệnh mở rộng

-q --im lặng
chế độ yên tĩnh, in không có cảnh báo và lỗi

-v --dài dòng
chế độ tiết, chi tiết xử lý in

-d --gỡ lỗi
chế độ gỡ lỗi, in thông tin gỡ lỗi

-ll --log-level [l] evel: hằng số chuỗi
(nghiêm trọng, lỗi, cảnh báo, thông tin, gỡ lỗi, theo dõi)
sử dụng mức l cho trình ghi nhật ký

-lc --log-config [f] ilename: string
sử dụng tệp cấu hình f cho trình ghi nhật ký

đầu vào lựa chọn
định dạng tệp đầu vào:

+ f --read-file
đọc định dạng tệp hoặc tập dữ liệu (mặc định)

+ fo - chỉ đọc-tệp
chỉ đọc định dạng tệp

-f --read-dataset
đọc tập dữ liệu mà không có thông tin meta tệp

cú pháp chuyển đầu vào:

-t = --read-xfer-auto
sử dụng nhận dạng TS (mặc định)

-td - đọc-xfer-phát hiện
bỏ qua TS được chỉ định trong tiêu đề meta tệp

-te --read-xfer-ít
đọc với VR little endian TS rõ ràng

-tb --read-xfer-big
đọc với VR big endian TS rõ ràng

-ti --read-xfer-ngầm
đọc với VR ít endian TS tiềm ẩn

hình ảnh xử lý lựa chọn
lựa chọn khung:

+ F --frame [n] umber: số nguyên
chọn khung được chỉ định (mặc định: 1)

+ Fr --frame-range [n] umber [c] ount: integer
chọn khung c bắt đầu bằng khung n

+ Fa - tất cả các khung
chọn tất cả các khung

Vòng xoay:

+ Rl - xoay trái
xoay hình ảnh sang trái (-90 độ)

+ Rr - chuyển động sang phải
xoay hình ảnh sang phải (+90 độ)

+ Rtd - chuyển động từ trên xuống
xoay hình ảnh từ trên xuống (180 độ)

lật:

+ Lh - trượt theo chiều ngang
lật hình ảnh theo chiều ngang

+ Lv - trượt theo chiều dọc
lật hình ảnh theo chiều dọc

+ Lhv - trượt cả hai trục
lật hình ảnh theo chiều ngang và chiều dọc

mở rộng quy mô:

+ a --recognize-khía cạnh
nhận dạng tỷ lệ khung hình pixel (mặc định)

-a --ignore-khía cạnh
bỏ qua tỷ lệ khung hình pixel khi chia tỷ lệ

+ i - nội suy [n] umber của thuật toán: số nguyên
sử dụng nội suy khi chia tỷ lệ (1..4, mặc định: 1)

-i - không nội suy
không nội suy khi chia tỷ lệ

-S - không chia tỷ lệ
không chia tỷ lệ, bỏ qua tỷ lệ khung hình pixel (mặc định)

+ Diễn viên Sxf --scale-x-factor [f]: float
chia tỷ lệ trục x theo hệ số, tự động tính toán trục y

+ Diễn viên Syf --scale-y-factor [f]: float
chia tỷ lệ trục y theo hệ số, trục x tự động tính toán

+ Sxv --scale-x-size [n] umber: số nguyên
chia tỷ lệ trục x thành n pixel, tự động tính toán trục y

+ Syv --scale-y-size [n] umber: số nguyên
chia tỷ lệ trục y thành n pixel, tự động tính toán trục x

phương thức chuyển đổi LUT:

-M --không có phương thức
bỏ qua phép biến đổi LUT phương thức được lưu trữ

+ M - phương thức sử dụng
sử dụng chuyển đổi phương thức LUT (mặc định)

Biến đổi VOI LUT:

-W - không có cửa sổ
không có cửa sổ VOI (mặc định)

+ Wi --use-window [n] umber: số nguyên
sử dụng cửa sổ VOI thứ n từ tệp hình ảnh

+ Wl --use-voi-lut [n] umber: số nguyên
sử dụng bảng tra cứu VOI thứ n từ tệp hình ảnh

+ Wm --min-max-window
tính toán cửa sổ VOI bằng thuật toán min-max

+ Wn --min-max-window-n
tính toán cửa sổ VOI bằng thuật toán min-max,
bỏ qua các giá trị cực đoan

+ Wr --roi-min-max-window [l] eft [t] op [w] idth [h] Eight: integer
tính toán cửa sổ ROI bằng thuật toán min-max,
vùng quan tâm được xác định bởi l, t, w, h

+ Wh --histogram-window [n] umber: số nguyên
tính toán cửa sổ VOI bằng thuật toán Biểu đồ,
bỏ qua n phần trăm

+ Ww --set-window [c] nhập [w] idth: float
tính toán cửa sổ VOI sử dụng tâm c và chiều rộng w

+ Wfl - hàm tuyến tính
đặt hàm VOI LUT thành LINEAR

+ Wfs --sigmoid-function
đặt chức năng VOI LUT thành SIGMOID

trình bày chuyển đổi LUT:

+ Pid - hình dạng bảo mật
đặt hình dạng LUT của bản trình bày thành IDENTITY

+ Piv - hình ngược
đặt hình dạng LUT của bản trình bày thành INVERSE

+ Pod --lin-od-shape
đặt hình dạng LUT của bản trình bày thành LIN OD

lớp phủ:

-O - ​​không có lớp phủ
không hiển thị lớp phủ

+ O --display-overlay [n] umber: số nguyên
hiển thị lớp phủ n (0..16, 0 = tất cả, mặc định: + O 0)

+ Omr --ovl-Replace
sử dụng chế độ lớp phủ "Thay thế"
(mặc định cho lớp phủ Đồ họa)

+ Omt - ngưỡng -ovl
sử dụng chế độ lớp phủ "Thay thế ngưỡng"

+ Omc --ovl-bổ sung
sử dụng chế độ lớp phủ "Bổ sung"

+ Omv --ovl-invert
sử dụng chế độ lớp phủ "Invert Bitmap"

+ Omi --ovl-roi
sử dụng chế độ lớp phủ "Khu vực quan tâm"
(mặc định cho lớp phủ ROI)

+ Osf --set-foreground [d] ensity: float
đặt mật độ nền trước của lớp phủ (0..1, mặc định: 1)

+ Tính chất của Ost --set-Ngưỡng [d]: float
đặt mật độ ngưỡng lớp phủ (0..1, mặc định: 0.5)

hiển thị chuyển đổi LUT:

+ Dm --monitor-file [f] ilename: string
hiệu chỉnh đầu ra theo đặc tính của màn hình
được định nghĩa trong f

+ Dp --printer-file [f] ilename: string
hiệu chỉnh đầu ra theo đặc tính của máy in
được định nghĩa trong f

+ Da --ambient-light [a] mbient light: float
giá trị ánh sáng xung quanh (cd / m ^ 2, mặc định: tệp f)

+ Di --illumination [i] llumination: float
giá trị chiếu sáng (cd / m ^ 2, mặc định: tệp f)

+ Dn - mật độ tối thiểu [m] mật độ quang tối thiểu: float
Giá trị Dmin (mặc định: tắt, chỉ với + Dp)

+ Dx - Mật độ quang gần tối đa [m]: float
Giá trị Dmax (mặc định: tắt, chỉ với + Dp)

+ Dg --gsd-function
sử dụng GSDF để hiệu chuẩn (mặc định cho + Dm / + Dp)

+ Dc --cielab-function
sử dụng hàm CIELAB để hiệu chuẩn

khả năng tương thích:

+ Ma --accept-acr-nema
chấp nhận hình ảnh ACR-NEMA mà không có trắc quang
giải thích

+ Mp - bảng màu thụ động
chấp nhận các thẻ thuộc tính bảng màu không chính xác
(0028,111x) và (0028,121x)

+ Mc - kiểm tra độ sâu
kiểm tra giá trị thứ 3 của bộ mô tả LUT, so sánh
với độ sâu bit dự kiến ​​dựa trên dữ liệu LUT

+ Mm --ignore-mlut-depth
bỏ qua giá trị thứ 3 của bộ mô tả LUT phương thức,
tự động xác định bit cho mỗi mục nhập bảng

+ Mv --ignore-vlut-depth
bỏ qua giá trị thứ 3 của bộ mô tả VOI LUT,
tự động xác định bit cho mỗi mục nhập bảng

Định dạng TIFF:

+ Tl --compr-lzw
Nén LZW (mặc định)

+ Tr --compr-rle
Nén RLE

+ Tn --compr-none
Không nén

+ Pd --predictor-default
không có dự đoán LZW (mặc định)

+ Pn --predictor-none
Dự đoán LZW 1 (không có dự đoán)

+ Ph --predictor-horz
Dự đoán LZW 2 (chênh lệch ngang)

+ Rs --rows-per-strip [r] ows: integer (mặc định: 0)
hàng trên mỗi dải, mặc định 8K mỗi dải

Định dạng PNG:

+ il --interlace
tạo tệp xen kẽ (mặc định)

-il --nointerlace
tạo tệp không xen kẽ

+ mf --meta-file
tạo thông tin meta tệp PNG (mặc định)

-mf --meta-none
không có thông tin meta tệp PNG

các phép biến đổi khác:

+ G --grayscale
chuyển đổi sang thang độ xám nếu cần thiết

+ P - đổi cực
thay đổi cực (đảo ngược đầu ra pixel)

+ C --clip-region [l] eft [t] op [w] idth [h] Eight: integer
vùng hình ảnh clip (l, t, w, h)

đầu ra lựa chọn
chung:

-im - hình ảnh-thông tin
in chi tiết hình ảnh (yêu cầu chế độ tiết)

-o - không có đầu ra
không tạo bất kỳ đầu ra nào (hữu ích với -im)

tạo tên tệp (chỉ với --frame-range hoặc --all-frames):

+ Fc - bộ đếm khung sử dụng
sử dụng bộ đếm dựa trên 0 cho tên tệp (mặc định)

+ Fn - sử dụng-khung-số
sử dụng số khung tuyệt đối cho tên tệp

Định dạng hình ảnh:

+ op --write-raw-pnm
ghi PGM / PPM nhị phân 8 bit (mặc định cho tệp)

+ opb --write-8-bit-pnm
ghi ASCII PGM / PPM 8-bit (mặc định cho stdout)

+ opw --write-16-bit-pnm
ghi ASCII PGM / PPM 16-bit

+ opn --write-n-bit-pnm [n] umber: integer
ghi n-bit ASCII PGM / PPM (1..32)

+ ob --write-bmp
ghi BMP 8 bit (đơn sắc) hoặc 24 bit (màu)

+ obp --write-8-bit-bmp
viết bảng màu 8-bit BMP (chỉ đơn sắc)

+ obs --write-24-bit-bmp
viết BMP truecolor 24-bit

+ obr --write-32-bit-bmp
viết BMP truecolor 32-bit

+ ot --write-tiff
ghi TIFF 8-bit (đơn sắc) hoặc 24-bit (màu)

+ trên --write-png
ghi PNG 8 bit (đơn sắc) hoặc 24 bit (màu)

+ on2 --write-16-bit-png
ghi PNG 16 bit (đơn sắc) hoặc 48 bit (màu)

GHI CHÚ

Các thuật toán nội suy ưu tiên sau đây có thể được chọn bằng cách sử dụng - nội suy
tùy chọn:

· 1 = thuật toán chia tỷ lệ miễn phí với phép nội suy từ bộ công cụ pbmplus
· 2 = thuật toán chia tỷ lệ miễn phí với phép nội suy từ tạp chí c't
· 3 = thuật toán phóng đại với nội suy song tuyến tính từ Eduard Stanescu
· 4 = thuật toán phóng đại với phép nội suy lưỡng cực từ Eduard Stanescu
Sản phẩm --write-tiff chỉ khả dụng khi DCMTK đã được định cấu hình và biên dịch với
hỗ trợ cho bên ngoài người cầu hôn Thư viện TIFF. Tính khả dụng của nén TIFF
tùy chọn phụ thuộc vào người cầu hôn cấu hình. Đặc biệt, thuật toán LZW đã được cấp bằng sáng chế
có thể không có sẵn.
Sản phẩm --write-png chỉ khả dụng khi DCMTK đã được định cấu hình và biên dịch với
hỗ trợ cho bên ngoài libpng Thư viện PNG. Lựa chọn --xen kẽ cho phép hình ảnh tiến bộ
xem trong khi tải tệp PNG. Chỉ một số ứng dụng quan tâm đến thông tin meta (TEXT)
trong một tệp PNG.

CHUYỂN KHOẢN TỔNG HỢP

dcml2pnm hỗ trợ các cú pháp chuyển sau cho đầu vào (dcmfile-in):
LittleEndianImplicitTransferCú pháp 1.2.840.10008.1.2
LittleEndianExplicitTransferCú pháp 1.2.840.10008.1.2.1
DeflateExplicitVRLittleEndianTransferSyntax 1.2.840.10008.1.2.1.99 (*)
BigEndianExplicitTransferCú pháp 1.2.840.10008.1.2.2
JPEGLSLosslessTransferCú pháp 1.2.840.10008.1.2.4.80
JPEGLSLossyTransferCú pháp 1.2.840.10008.1.2.4.81
RLELosslessTransferCú pháp 1.2.840.10008.1.2.5
(*) nếu được biên dịch với hỗ trợ zlib được bật

ĐĂNG NHẬP

Mức độ xuất nhật ký của các công cụ dòng lệnh khác nhau và các thư viện cơ bản có thể
được chỉ định bởi người dùng. Theo mặc định, chỉ các lỗi và cảnh báo được ghi theo tiêu chuẩn
dòng lỗi. Sử dụng tùy chọn --dài dòng cũng như các tin nhắn thông tin như xử lý chi tiết
được báo cáo. Lựa chọn --gỡ lỗi có thể được sử dụng để biết thêm chi tiết về hoạt động nội bộ,
ví dụ: cho mục đích gỡ lỗi. Các cấp độ ghi nhật ký khác có thể được chọn bằng cách sử dụng tùy chọn --log-
cấp. Trong --Yên lặng chế độ chỉ có lỗi nghiêm trọng được báo cáo. Trong các sự kiện lỗi rất nghiêm trọng như vậy,
ứng dụng thường sẽ kết thúc. Để biết thêm chi tiết về các cấp độ ghi nhật ký khác nhau,
xem tài liệu của mô-đun 'oflog'.
Trong trường hợp kết quả ghi nhật ký phải được ghi vào tệp (tùy chọn với xoay tệp nhật ký),
đến nhật ký hệ thống (Unix) hoặc tùy chọn nhật ký sự kiện (Windows) --log-config có thể được sử dụng. Cái này
tệp cấu hình cũng chỉ cho phép chuyển hướng một số thông báo đến một đầu ra cụ thể
luồng và để lọc các thư nhất định dựa trên mô-đun hoặc ứng dụng nơi chúng
Được tạo ra. Một tệp cấu hình mẫu được cung cấp trong /logger.cfg.

COMMAND ĐƯỜNG DÂY

Tất cả các công cụ dòng lệnh sử dụng ký hiệu sau cho các tham số: dấu ngoặc vuông bao quanh
giá trị tùy chọn (0-1), ba dấu chấm ở cuối cho biết rằng nhiều giá trị được phép
(1-n), kết hợp của cả hai có nghĩa là giá trị từ 0 đến n.
Các tùy chọn dòng lệnh được phân biệt với các tham số bằng dấu '+' hoặc '-' đứng đầu,
tương ứng. Thông thường, thứ tự và vị trí của các tùy chọn dòng lệnh là tùy ý (tức là chúng
có thể xuất hiện ở bất kỳ đâu). Tuy nhiên, nếu các tùy chọn loại trừ lẫn nhau, sự xuất hiện ngoài cùng bên phải
Được sử dụng. Hành vi này tuân theo các quy tắc đánh giá tiêu chuẩn của các trình bao Unix phổ biến.
Ngoài ra, một hoặc nhiều tệp lệnh có thể được chỉ định bằng cách sử dụng dấu '@' làm tiền tố cho
tên tệp (ví dụ: @ command.txt). Đối số lệnh như vậy được thay thế bằng nội dung của
tệp văn bản tương ứng (nhiều khoảng trắng được coi như một dấu phân tách duy nhất trừ khi
chúng xuất hiện giữa hai dấu ngoặc kép) trước khi đánh giá thêm. Xin lưu ý rằng
tệp lệnh không được chứa tệp lệnh khác. Cách tiếp cận đơn giản nhưng hiệu quả này
cho phép người ta tóm tắt các kết hợp phổ biến của các tùy chọn / tham số và tránh dài dòng và
các dòng lệnh khó hiểu (một ví dụ được cung cấp trong tệp /dumppat.txt).

MÔI TRƯỜNG

Sản phẩm dcml2pnm tiện ích sẽ cố gắng tải từ điển dữ liệu DICOM được chỉ định trong
DCMDICTPATH biến môi trường. Theo mặc định, tức là nếu DCMDICTPATH biến môi trường
không được thiết lập, tệp /dicom.dic sẽ được tải trừ khi từ điển được xây dựng
vào ứng dụng (mặc định cho Windows).
Hành vi mặc định nên được ưu tiên và DCMDICTPATH chỉ biến môi trường
được sử dụng khi từ điển dữ liệu thay thế được yêu cầu. Các DCMDICTPATH biến môi trường
có cùng định dạng với Unix shell PATH biến trong đó dấu hai chấm (':') ngăn cách
mục. Trên hệ thống Windows, dấu chấm phẩy (';') được sử dụng làm dấu phân cách. Từ điển dữ liệu
mã sẽ cố gắng tải từng tệp được chỉ định trong DCMDICTPATH biến môi trường. Nó
là một lỗi nếu không có từ điển dữ liệu nào có thể được tải.

Sử dụng dcml2pnm trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net