Đây là lệnh delta2maf có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
delta2blocks - công cụ bổ sung cho mẹ từ bản vá lỗi để sắp xếp căn chỉnh
delta2maf - công cụ bổ sung cho mẹ từ các bản vá lỗi để sắp xếp căn chỉnh
SYNOPSIS
khối delta2 [tùy chọn]< giới thiệuID><qryID>
delta2maf [tùy chọn]< giới thiệuID><qryID>
MÔ TẢ
-h Hiển thị thông tin trợ giúp
-q Sắp xếp căn chỉnh theo tọa độ bắt đầu truy vấn
-r Sắp xếp căn chỉnh theo tọa độ bắt đầu tham chiếu
-w int Đặt chiều rộng màn hình - mặc định là 60
-x int Đặt loại ma trận - mặc định là 2 (BLOSUM 62), các tùy chọn khác bao gồm 1 (BLOSUM 45)
và 3 (BLOSUM 80)
lưu ý: chỉ có ảnh hưởng đến sự liên kết axit amin
Đầu vào là đầu ra .delta của chương trình "nucmer" hoặc "promer" được chuyển vào
dòng lệnh.
Đầu ra là stdout và bao gồm tất cả các liên kết giữa truy vấn và tham chiếu
các trình tự được xác định trên dòng lệnh.
LƯU Ý: Không có phân loại nào được thực hiện theo mặc định, do đó, các căn chỉnh sẽ được sắp xếp như được tìm thấy trong
NS đầu vào.
Sử dụng delta2maf trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
