Đây là lệnh fa2dna có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình giả lập trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
fa2dna - định dạng cơ sở dữ liệu fasta để sử dụng với ANFO
SYNOPSIS
fa2dna [ tùy chọn | hồ sơ hữu ích. Cảm ơn ! ]
MÔ TẢ
fa2dna đọc một hoặc nhiều tệp ở định dạng fasta và định dạng lại chúng thành một cơ sở dữ liệu phù hợp
cho thông tin(1). (Các) tệp đầu vào có thể chứa nhiều hơn một chuỗi và mỗi chuỗi có thể
được chia thành nhiều đường viền bởi một đoạn Ns. Tất cả các mã không rõ ràng của IUPAC là
được hỗ trợ đầy đủ.
LỰA CHỌN
-V, - phiên bản
In số phiên bản và thoát.
-o tệp, - tệp đầu ra
Ghi đầu ra vào hồ sơ.hồ sơ nên kết thúc ở .dna, bởi vì thông tin và một số ở hạ lưu
các công cụ có thể vấp phải một tiện ích mở rộng khác. Mặc định là tên bộ gen với
các .dna gia hạn.
-m N, - maxn N
Đặt số lượng tối đa Nđược hiểu là mã không rõ ràng IUPAC để N; không tí nào
kéo dài hơn được hiểu là các đường nét riêng biệt. Mặc định là 2.
-g tên, --tên bộ gen
Đặt tên bộ gen thành tên. Tên này được lưu trữ trong tệp đầu ra và sẽ là
được sử dụng bởi thông tin để xác định bộ gen phù hợp trong đầu ra của nó. Bộ gen phải là một
tiền tố của tên tệp đầu ra để cho phép các công cụ hạ lưu tìm thấy nó. Tên
phải ngắn gọn nhưng độc đáo, như "hg18" hoặc "pt2" đối với người hoặc tinh tinh
bộ gen sẽ hoạt động tốt.
văn bản -d, - văn bản mô tả
Thêm văn bản như mô tả cho siêu dữ liệu. Đây hoàn toàn là thông tin.
-v, --verbose
Làm cho một chỉ báo tiến trình được in.
Sử dụng fa2dna trực tuyến bằng các dịch vụ onworks.net
